Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0012200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0084715 hsa_circPREX2_022
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:69005840-69030879 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68093605-68118644 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-317.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -338.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 297.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((.(((((.....((((((.....((((((...)))))).....))))))((((.((((((.....((((((((((.........))))))..))))...(((....)))....)))))).))))..................((((((((.((((((..(.((((.(((((((((....((((((...))))))(((....((((((((((((.((.......))))))(((((((.(((((.......((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..)))))).....))))).)))..)))).((((((.....))))))(((((....)))))........(((((((.......(((.(((((.((((...))))))....((((.(((.....))).))))......)))))).......))))))).(((.((((((((((.....(((((...(((.....((((((.((((((..........))))))...............((((((...))))))......))))))....((((((((....((((((((..........(((((((...........))))))).(((((((.((.((((((((.....((..((((.....((((........)))).......))))...))......))))))))))...)))))))..........))))))))..)))))))).((((((..((((((((.(((..(((((((((((.....((((..(((.((((................)))).)))..))))..))))).....))))))(((((((..((.(((.((((......)))).)).).)).)))))))......(((.(((((((((((.....((...((((........)))).)))))))...)))))))))....)))..)))))).....))..)))))).........)))...)))))....))))..)))))).))).((((.(((((...))))).))))))))))))......))))))))).....((..(((((...((...((((...........))))......))...)))))..))....))))))).).))))))))))))))..))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((.(((((.....((((((.....((((({...}))))).....))))))((((.((((((.....{(((((((((.........))))))..)))|{,.{((....))).,,.)))))).)))).....,{,......}},.((((((((.(((((({{({((((.,{,{(((((,.{{((((((...))))))|||.....((,(((((((......})))))},)},(({{(((.(((((.......((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..)))))).....))))).))),,)))).((((((.....))))))(((((....)))))..,,,....,{({{,....|||{,{,{{{{{,((({...))))}}.....(((((..(((((((..(({{{((.(((.....({.(((((((((((...((({{(({...,{....||..}}})))).{{{.{,,((({((,,,,.........}))))),..,},..........((((((...)))))).,{{{{||,,|,{{((((({(((,..,,{{{{||||..,,..,,..(((((((...........))))))).{{|||||||}||{,|}}}})),,,}))))},,,,,.}))))).))))).))....))).))))))..)))))))..))))){{{{{((((({{.,..........,,,,.,,,,}))))),))}((((((..((((((({.{{{..(((((({{(((...,,((((..(((.((({..............,,)))).)))..))))..}}})),....))))))(((((((..((.{((.((((......)))).)).).}}.)))))))......(((.(((((((((((.....,,...((((........)))).))))))}..,}))))))))....}},..)))))}.,}}..,..)))))).....(((((({{......)}.))))))..|||.{{{|,,|,((...((({.{.|||||..,,|||,,,,,)}}....))))),)))}}.}}.}..}|||.}}}||..,,||,,,,}),}.)}})))))),,..{|,,||{||.,.,.,,})))}))),.}.))))))))))))))..))))).))..
Forensic Context

No forensic context available.