Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0000300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PREX2_0133
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:68889845-68892225 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:67977610-67979990 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-601.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -652.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 638.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(....((((.(((((.(((((...(((((((((.....(((((((((((...(((((...........))))).(((((((((((.....(((((((((..(((...((((((((((((...))).)))).).))))....)))))))).........(((((((........)))))))((((((((..((((((((..((((((((((((...........((((((.....))))))))))))))))))(((((((((....((((((..........((.....))..(((((((.((...((((((((......)))))))).)).))))))))))))).(((((.((.((...(((((.((......))..)))))...)).)).))))).))))))))).((((((.....(.((((((.......))).))).)......))))))((.(((...((((((((.((((((((((.((((....))))..)))))...(((.(((((....((.....))..)))))..)))..))))).))))......))))))).))((((((((((....................)))))))))).....))))))))))))))))...(.(.((((((.....)))))).).)))))....))))))))))).....((((((..((((.((((((((...((..((((((.(((.(((..((((.......(((((((((((..(.(..........((((((((((...((((((((((.((((((......((((((((.((((.(..((((((........))))))..).))))...............(((((((....))))))).......(((..((...))..)))(((...))).......)).))))))..))))))...((((.(((...))))))).((((..((((.....))))..))))............)))))))))).(((((((((((.((.......(((((.((....)).)))))......))))))))))))).))))...))).)))........).)..)))))))))))...))))..)))..)))))))))..)))))))))).))))..)))))).........(((.(((((((..(((((..(((((((.((((.((((.(((........)))...)))))))).))))))).........)))))..))))))).)))..(((((..((((.(((((..(((..(((....))).)))))))).)))).)))))..........)))))))))))..)))))))))..((((((........)))))).......((((((((.((((..........))))))))))))............(((((((((((....((((((.(((((((.((((((........))))))((((((((.(((.....))).)))))))).((((((..(.((((((.(((.............))))))))).)..)))))).)))).(((((...(((((((((((..((((.........((((((((((((....((((.......)))).....(((.(((.((((((..((((..(....)..))))..)))))).))))))...((((...(((((((....)))))))..))))(((.......)))...(((((((.............)))))))........))))))))))))..))))..)))))))))))....))))).......)))))))))......)))).)))))))..)))))..(((((((...(((.(((((((((.......(((((.........(((((((((((.(........).)))))).)))))..........))))))))))).)))...)))..)))))))..(((((..............)))))((((((......(((.((((((...((((((((..........((((....))))(((((((((((((((....))))))).((((....)))).......))))))))))))))))...)))))).)))..)))))).......))))).)))).....)..((((..(((((............((((((((((((((((((.....((((((..(((((((...))))))).....))))))......(((((((((.((((......))))))....)))))))(((((...((((((....)))))).....))))).(((......)))..))))))).)))))................))))))......)))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.{...({{((((((.{(,((..{{(.(((.{{.(((((((((.,...{((.||(({.........{{{{{({({(((((((({{{.,...{({,,((((,.(((...((((((((((({...})),}))).).),))....}||||||,.........(((((((.,....}.)))))))||||||||..|||||,{|.,((((((((((((..........{((((((.....))))))))))))))))))|((((((((....,,{|{{,,{,,{|...,{.....}}..(((((((.({.{,(({(((((......)))))))).)).))))))))))))|{{({((.((,((.,,((({(.{{......,}..)}}},...||,|}.}}}}}}))))))))}.(((((({(...{.((((((.......))).))).}...}},)))))),,.{{{||||||,{(({.{(((((((((.((((....))))..))))),,.{((.(((((....({.....}}..)))))..))),.))))},)))}..,,,})))}}}}.,|({((({((((,....,,.......,,.,,.))))}|}||,,{{,.,,}||||}}}}})))),{{{}||}{{{|{,.,,,,}}}}}||||||,,..}.}}))))))))).,.}}}|||||...||}},,...,,,.))))))...))).).)))...}.))))).)))).,,,,.))).})))},)).)))))).||,...}}....|{.{{{({{.,..})).))).},,}},...}))(.(((.((((((((((((...........,,{({{{{,.,({.,,{{,,,,(((((({....}))))))......,{{{..{{...||,,|||((((.,..(((({{{{,{,.{(((({,({({.{{..{{{,{(((...))))})}.,||.,}||||,,,.,,,})}}))}})}})})}}},.,{{{{...((((.((((.(((((.....))))).)))).))))..)))))}}}}},.((((((((.(((((,.,((((..((({.,,.{{.....((((.(((((((((.{(({.(((.........})).}))||{{.,,,||||,.....,,}})),}})},...))))))))).)))).....})(((((((.((((.((((.{{{........})}...)))))))).))))))){(((.{({{.....((((((((((((.,{(,..........(((((((((((...((((((.((({.,{(({....}))}{{{....}}}...}))).)))))))))))))).))}.{{(({(,{,,,...}))}|}}.|,,..{{{((((,,((({,,.......,|}}}})))}))),,,.........(((((((((((.,{,((((((.(((,{{{.((((((,,...,,.))))))((((((((.(((.....))).)))))))).((((((..{.((((((.(({.............})))))))).)..)))))).||||{(((({...(((((((((((..((((.........((((((((((((.,..((((,,..,..}}}}.{|,.(((.(((.((((((..((((..(....)..))))..)))))).))))))...{(({...(((((((....)))))))..)))){{,.......,,}...|{{{{{{.............}}|||},....,,,.))))))))))))..))))..)))))))))))....,))}}.......))))))))}....,,))))}},))))},,,(,,{{{,{,,,,|,,.{||.(((((((((.......{{(((.........{(({{{(((((.,........|.))))}}..,,}},.........))))})))))).)))...)))..,||||||,{|||{|||............|,|||((((((......(((.((((((...(((((((({........,((((....))))|(((((({(((((((....))))))).((((....)))).......))))))))))))))))...)))))).)))..)))))}}))),,,.....}}}}}},}))|,|||,|||{{,,,,,,....,,,,.,,..(((((.....)))))...,,,}}||}}}},}}}}}||||||....,}}}))))))}}})},,.})))).}},))))))))))))}}}}...}}},..((((((...((((((....)))))).....)))))).)))).)))))))))).)))).)))).....,,}}}}}..,,,}))))}}))))))))))).))))
Forensic Context

No forensic context available.