Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0003700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PREX2_0173
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:68939457-68995623 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68027222-68083388 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-392.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -424.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 492.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((.((((((((..((((((((((...((((((((....)))((((((.(((.......)))...))))))((((.(.((.((.......)).))).))))......((((((((((.(....((....(..(((((((((((((..(.((((((.(((((((..(((((((.((((((((...(((....(((.........)))....)))....))).....)))))))))).))..)))....)))).)))))).)....))))))))....)))))..)...))....).))))))))))...((((.((((((...)))))).)))).))))).))))))))))..........(((((.(((((..(((...........(((.((((.........((....((((((((.....((.((.(((((((...((((..........))))))))).)).)).))......))))))))...)))))))))...((((((((((((....)))))))....)))))......(((((.((((.(.((.........)).).))))))))).)))...))))).))))).((((((((..........(((.((((.........)))).))).((((((((((((((((((.((.((((((((....(.((((.(((((((((.(((((((.....))))..........))).))))...........)))))..)))).).........((((((....(((((....(((((....)))))........((((((((((((....((((((.....(((((.((((.....)))).))..((((...))))...((((((((.((((.........)))).)).))))))((((((..(((......)))..)))))).....(((((.((((((((.......((((((((.......))))))))..(((.((((....(((((.((((((((.........))))).))).)))))))))))).(((((...........)))))..(((((((((....((((((((.((((((((((((.((((........))))....((.((((...((((((.............))))))....)))))))))))...))))))).)))))))).........)))))))))..((((((.((((.(..(((.(((((((((.((((........)))).)))....))).))).)))..).))))...))).)))......(((((((....)))))))......)))))))).))))).....))).....))))))...))))))))))))((((..........)))).........(((((......)))))......)))))((((.((((.((....)))))))))))))))).........))))))).....).))..)))))))))....)))))))))...(((((.....)))))......)))))))).............)))))))))))((((.((.((.....)))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
........{((.((((((((..,,..(((((,...||||}{{,.{{{|||,{,(((((((,,.,,........|,.|,,{{,{,{.,{,{{,,.....},.)),}))))}},...((((((((((.,....{{{{..{..((((((((((((({,,.((((((.(((((((..{((((((,((((({{{...(((....(({.........)))....))}....))).....)))))))))),))..)))....)))).)))))).)}},.}}))))))....)))))..)...)}....}.))))))))))...((((.((((({...)))))).)))).{{{(((((((((((((({{{({....(((((((,,.,..,,|}}}}||,....(((.((((.........((....((((((((.....((.((.(((((({..{((((..........))))))))).)).)).))......))))))))...))))))))).||||{{{{||||||.,..))}||||||..,||.||,....|,.||},{{|,||||,........,,.}||||||||||,,||...}||||{|.{{{((..(((((.,((({,..,|(||{{({..........|,{{..,.{{{,|||||,,{,{{{{{,||,,,||,,,|.,}}|.,,||}}}.|||||...||}}|||,....,,},......,,.||},||||,,,,....}}|}..}}.,}},)})}))))}}}}},,}}|.}}}}|.||,,||{||{||,.{|||||{,,||||,((((((((((((....((((((...,.{{{((.((((.....)))).))..((((...}}}}..,((((((,{.((((,,,,.....}}}|.||.|||}}}{(((((..(((......)))..)))))}.,,,,|,.,,.(((((((.(((({..,{{{{{{{|{..,,,,{{{{{{.{,..,.,)})))))}..,|}{|||||||.......)}))),)})))})|||,||||,,},))}},,,},}.....}}}}.||||{{{{{(((,.,,({(((({{.((((((((((((.{{((,......}))))....((.((((...((((((.,.........,.))))))....))))))))))).,,}}))))).)))))))}.}}.....,)))))}}},..((((((.((((.{..(((.(((({{{{{.((((,,,,....}})}.)))},,,))),))).)))..}.))))...))).)))......,(((((({...|||||||,.....,}))))))})))))}|,,,|}}.....))))))...)))))))))))){(((.,,.......},,,........,(((((......)))))..,...|||,.||||{,(({,,{.{.{||{{{|.,{(((((........)))))))))),....,})).}})))))}}),,.}),,))))))...|||||,..,})))))},},,.,}}||}},...,}}},,....)))))))))))((((.((.((.....)))).))))
Forensic Context

No forensic context available.