Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0004500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PREX2_0130
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
8:68948875-68973014 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68036640-68060779 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-561.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -603.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 456.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............((((((.(......((((((((...(((....))).((..((((((....)))))).))(.((((((.....)))))).)(((((((((........)).)))))))((.((((((......((.(((((((...............(((.(((.(((((((.((((..(((((((.(((.((.(((((((.((..(....)..))))))))).)).))))).))))).)))).)))).....((((....)))).))).))).))).)))))))))...)))))).))..........................(((((((((.((((((...............)))))).........((((((((.((((........)))).)))))))).....((((((((((((((((...(((.......((((.(((((((((((.((.((..((........))..)).))))))))))))).))))((((((((((.........)))))))))).......((((.((((((..((((((((((..((.((((..(((((.....((.((((((...)))))).)).................((((((...)))).)).((((........))))(((((......))))).....)))))..)))).))..)))))))))).)))))).))))........((((....))))...)))..))))))))))))))))......)))))))))(((((.((((((((((((((((.(((((((((.((((....((((((((.((((((.(((((...((((.(((((((.....(((((((....((..(((((..((((((..(((((.(((.(((..((((((((...(((((..(((((..((((......(((..((((((((((................))))....))))))....)))......))))....))))))))))((((((............((((((((....(((((((((((..(((((........(((((((...))))))).........(((((..((((((....)))).)).)))))..........((((....))))..(((((((((.....)).))))))))))))...)))))))))))(((((((.......)))))))....))))))))...(((((((((((((((.((((((((....(....)....)))))))))))))............))))))))))))))))...))))))))..))).))).)))))..))))))..)))))..)))))))))....)))))))..))))(((.....)))..((((...((((((((........))))).))).((((((((.........((((......))))...............((((..((((((.........((((((((.((((((...(((((((...((...((((.(((..........))).))))))..))))))))))))).))....))))))........))))))..))))........(((((((((((.((.........(((((((........))))))).....(((.((((.........((....((((((((.....((.((.(((((((...((((..........))))))))).)).)).))......))))))))...)))))))))...((((((((((((....)))))))....)))))......(((((.((((.(.((.........)).).))))))))))).)))))))))))..)))))))).((((((((...))))))))........))))))))).))))))...........((((((.((..((...(((.((((.(((((((((.(((((((.....))))..........))).))))...........)))))..))))...)).)....))..)).)))))).....)))))))))))).))))....)))))..))))).)))....))).))))).)))))((((.....))))..))))))))......).))))))....((((.........)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
............{,,{,,.,...,,{(((((((({,,(((....|||,,,..((((({....})))))|}}|,((((((.....})))))..(((((((((........)).)))))))..|{{{{,|.,,{||{{{(((({,,.............{{((({((({((..,,|}|}}},.,..,{{{}|||,{(,(({{{{|,||,.{.,,,}..}}}})))))}))})))}}.)))),,||||{|||.....,{|||,,,.)))),,,.)))),),)..,..|||{{{..,||||{{{|..........................(((((((((.,{((((...........,...}}}}}}.........{(((((((.((((........)))).)))))))|{{{,.{{((((((((((((((...(((,{(((({((((.(((((((((({,{(.((..((........))..)).)}))))))))))).)))},,||}}}|{(((((({,,..,,,.....,..},}}))))}.((((((..((((((((((..{(,((((..(((((.....((.((((((...)))))).))............,,...({((({...)))).}}.{{{{........)}}|(((({......))))),....}))))..)))),}}..)))))))))).)))))).,,,,....,..,(({{...,))}}...)))..))))))))))))))))}),...)))))))))(((((.((((((((((((((((.(((((((((.((((....((((((((.((((((.(((({..,((((.(((((((.....(((((((....((..(((((..((((((,,(((((.(((.(((..((((((((..,((((,.{(((,,,{,{,.......|||}}|||||,((({,,,,......|||,..}}}}....|}||||,,|,|,},,,,,,,,,},}}}))),))))))((((((............(((((((({{,.(((((((((({.,(({(((({{{{,.(((((((...))))))).........(((((..{{((((....)))).}}.))))).,,,,...,,({{(,,,,}}}}....{{{{|||,....,),)))))))))))).,,))))))))))){((((({,,....,))))))),,}.})))))))...((((((((((((((,,((((((((...,(,,...,}},)))))))))))))............))))))))))))))))...))))))))..))).))).))))).,))))))..)))))..)))))))))....)))))))..))))|({.....}},.,((((...((((((((........))))).))).((((((((.........{{{{......||||...............{{{(..((((((.........((((((((.((((((...(((((((...{(...((((.(((..........))).)))))}..))))))))))))).))....))))))........)))))).,)))},,......(((((((((((.{{,,,{,,,..(((((((........))))))}.....(((.((((.........((....((((((((.....((.((.(((((({..{((((..........))))))))).)).)).))......))))))))...))))))))).,|{(((((((((((....)))))))},...}}}}}}}},.{{{((,{{((.({({,........}}.)})))))))))}}.)))))))))))..)))))))).((((((({...})))))))........))))))))).))))))........{((((((((.{(,,{{...,{(.((((.(((((((((.{((,,((.....,,}},.........))}.)))).........,,)))))..))))...,}.,....})}.)}.)))))),))}.}))))))))))).))))....)))))..))))),,))....))).))))).)))))((((.....)))),{||,}}}}}.....,),)},}},,.,,}}}}}.)}}}}}.,}}),
Forensic Context

No forensic context available.