Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0009000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PREX2_0107
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:68990676-68991218 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68078441-68078983 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-109.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -121.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 136.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((......(((.((.(.(((((((((((((((....(((((........)))))..)))))))((((...((((..((((.(.(..((((((((...................))))))))..).)))))...))))...))))...))))))))).))..)))............((((((...))).)))(((((((((.(((((((((.((((...)))).))).))))))............((((((((.....(((((((((.((((((((...((((((.(((......))).)))))).....((((....))))...((((..(((((........))))).)))).........)))))))).))....))))))).........((((......))))..))))))))(((((((((((........(((((((.(((((.(((.((....))))).)))))........))))))).........))))..))))))).))))))))))))...))((.....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..,(((.,....(((.(({({{((,,,,,{((((((.{{.{((((........)))))}}))))))}((((...((((..((((.(.(..((((((((,{(.........,,.},..))))))))..).))))),..))))...))))...,})))}}))})}..)))...,,......,|(((({,,{,}}..,|{||||||||.(((((((((.((((...)))).))).))))))....,{{{{...((((((((.....{((((((((.((((((((...((((((.(((......))).)))))).,,,.((({,...,},...,}}}},,.,|||....,{,,|.,,},}}}..........)))))))).)),...))))))}.........{(((......)))}..)))))))),|||||,((((...,,...(((((((.((({(.({{.,,,,,.})))).)))))........}))}))}..,......))))..})))))),))))))))})))...))({.....})
Forensic Context

No forensic context available.