Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0009500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PREX2_0153
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:68992678-69009436 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68080443-68097201 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-251.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -268.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 224.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.....((((((.((((.(..(((.(((((((((.((((........)))).)))....))).))).)))..).))))...))).)))......(((((((....)))))))......(((((((((..(((.((((((........)))))).))))))))))))((((..........)))).........(((((......)))))......)))))(.....((((....((((.(((((...(((........)))((((.((((((((((((.((..(((((...))))).(((((..(((((.....))))).)))))..(((((.........((.(((((((..(((.((((.(((((((.((((((((.....(((((((.........)))).))).....)))))))).....(((((((....((((...((((..((((.(((((((.........)))))))))))))))..))))....)))))))(((((((((((.((..((.(((((((((((((..((((...(((((......))))).))))..)))))...(((((.........))))).((.......))..)))))))).)).....)).))))).))))))...)))))))..)))).)))...............((((((((((.........))))))..))))...(((....)))...))))))).)).........)))))...)).)))))))))))).)))).....))))).))))...((((((((...))))).))).....((.(((((((......))))))).))))))..((((...))))....((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..)))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(((({...,((({{.((((.{..(((.((((({{{{,((((,,,,,,,.}}}}.)))}}},))),))).)))..}.))))...|||,|||.,....(((((((....)))))))......(((((((((..(((.((((((........)))))).)))))))))))),((({{{,......,...........,(((((......))))),......,,}}||}},,{||,.,.,{{((,(({{{,,{{((........}}|||((.((((((((((((.(({{((,{,..,{{|,,.(((((..(((((,....))))).})))}.,{{{{{...,,,||{{{.{((((((..({(,((((.(((((((.((((((((.....(((({{{.........))},}))).....)))))))).....(((((((....(({(...{{((,,{(({.((({(((.........))}}})))))))))),.))))....)))))))(((((((((((,|,,,({.((((((((,,(((..((((...(((((......))))).))))..}||||...(((((.........))))).,,.}}}}..}),.)))))))).)}.,.,,},.})))).))))))...)))))))..)))),)}},.......,,.....{(((((((((.........))))))..)))|,,.{((....))).,.))))))).}}||.....,,}}.))}}.)).)))))))))))).))}},....)}))).)))),..((((((((...)))))},)).....((.(((((((......))))))).)),,))}.,,,)))}).)|....((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..)))))).)
Forensic Context

No forensic context available.