Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0009900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PREX2_0126
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:68996981-68999480 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68084746-68087245 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-572.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -623.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 584.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........))(((((((.......(((((..(((((((((((.((((((((((...(((((..(((((.(.....((((((..(((.(((......))).)))...))))))((((.............)))).......((((((....))))))...).))))).)))))......((((((((.....))))))))...(((((...(((((.........(((((.((((.(((((((((...........)))))).))).))))..))))))))))...)))))(((((.((((((((((....))))))...((((....))))..........((((((((((...(((((((((.((((((((((((.......))))))))..(.(((((((((...(((((((...................(((((((((.....)))))))))..))).))))...)))))...)))).).)))).)))))))))...))).((((((.(((((...............((((((((....((.((((((((............((((...))))....((((((((((((((.....)))))))))))))).((((..((((...(((((......((((((..(((((........)))))..).))))).....)))))..))))..))))..)).)))))).))..))))))))((((.((((....)))))))).....)))))))))))...(((((((....))))))).....((((((((....((((((((((.....(((((((((((.........(((((((((.(((((((((((.((....(((((.((....((((((...((((.((.(((((((...............(((((((...)))))))....(((((((.((.......(((.((((...(((((((((..((((..((((((((((((((((((((..(((((.((((.((((..(((..(((((...........((((........))))....(((((..((((...))))))))).........)))))((((((...))))))((((((..((((((((.....................))))))))..))))))((.(((((..(((((...))))).....))))).)).............(((((......)))))..)))..))))..))))..)))))..))))))))..................))))))).......(((((((....)))))))((((((..(((((..........)))))..)))))).(((((((((((((.(.(((.........((((........(((((.(((.((((.......)))).))).))))).........))))...(((....)))((((((((((.................((.((.(((.(.((..(((((.......))))).)).).))).)).))..)))))))))).(((((((((.(((.(((.......(((.(((((.........))))).)))...))).((.((((((((..........)))))))).))..))).)))))))))...((.((((.......)))).)).........(((...)))........((((((((.((.(.((........))...((((.....)))).....((((((((....))))))))).)).))))))))..............))).).)))))))))))))............((.(((((((((((((.......).))))))).....))))).)).((((((..(((((..(((((..((((.........))))......))))))))))..........)))))))))))))))..)))))...)))).....))))...)))...)).)))))))..................................(((((((((.(((((...............(((((((......((........))...)))))))))))).))...........)))))))......(((((....)))))....))))))))))))).))))))........((((..((((((.....)))))))))).)).)))))...)).))))))))......))))))))))))...(((.((((((((((...((..((....))..))..)))))))))).)))..........)))))))))))...))))))))))...))))))))...)))).))))))).))))).............)))))))))).))))(((((......(((................)))......)))))(((((.((((....(((((((....))))..)))..))))...)))))..)))))))..)).))).......)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,....,.))(((((((.......{((((..(((((((((((.((((((((((,..(((((..(((((.{.....{(((((..(((.(((......))).)))...)))))}((((.............)))).......((((((....))))))...}.))))).))))).,,,..((((((((.....)))))))},{{.{{{{,,,(((((,....,,..{((((.((((.(((((((((...........)))))).))).))))..))))|{{{((({((,,.,{((((,((((((((((....)))))},))}|{{...,|},,...........,,||,((((...(((((((((.((((((((((((.......))))))))..{.(((((((((...(((((((.{,.......,........(((((((((.....)))))))))..))).))))...)))))...)))).,.)))).)))))))))...)))}{((((,,(((((.{{............((((((((....{{.((((((((.,,,........||||...,,,,....((((((((((((((.....}))))))))))))).{(((..((((...(((((......((((((..(((((.{....}.)))))..}.))))).....)))))..))))..))))..)),}))))).}}..))))))))((((.((((....)))}))))..}}.))))))))))}...(((((((....))))))),....,(((({,,.,,,,,,,||||||}|.,,(((((((({{{.,,{,....(((((((((.,{,((((((((.{{.,,.(((((.((,.,.((((((...(((,,((.(((((((...,,..,......,(((((({...}}}}|||....{||{{{{,||,,,,,,.,|{|{{{{...{,,,(((((..((((,.,(((((((((((((((((((..(((((.{{{{.{{{{..((,.,{{{((||.......,,|{||,,,.,,..}}}},|..(((((.,({{{.,,)}},))))).,.,,..,,|||,.((((((...))))))((((((..((((((((.....................))))))))..))))))((.(((((..({(((,..}}))),....))))).)).............{((((.,....}}))}.,})}..}))).,)))),,)))))..))))))))}.................,)))))).,.....{((((({....})))))}((((((..(((((..........)))))..)))))).(((((((((((((.,,{{{.........((((........(((((.(((.((((.......)))).))).))))).........))))...(((....|}}(((((({{{{..........,,,||,,,,,||..,,.|||||{(({,,.....,.,||},......))},},}}},.})))))}}}}.(((((((((.(((..,,.......(((.(((({.{{....}}))))).)))...,,|.((.((((((((..........)))))))).))..))).)))))))))...{{.((((.......)))).}}..,......,})}.,,|||...,,,.((((((((.{({(,((........))...{{({.....}})}.....{(((((((....)))))))}}})),)))))))),,,.....,,,....,,.}.)))))))))))))......,.....{{.(((((((((((((.......),})))))),....})))).),.((((((..{{{{{,{(((((..({{{.........})))......))))))))}}..........)))))))))))))))..)))))...}||}..,,.}}}}.,}},,,..}}.))))))).......,,.,..............,,{{{{{.,|,,,}}}}||||{|{,............|{(((,,,,...,,}||.,.,,,,.,,...}}}},}}|||||..,.........,)))))}||,......,||,......}))....))))))))))))).)))))).,......{{{,,{((((({.....})))))))}}.}}.}}))).}}}},))))))))....,,},,)))))))))....||,||{{||||||....,.}|}}},})...}},.,}},,}))))},}...}}}}}}}})},,,)))))))}}}}))},))).(((((((.(({...)))...))))))),.{||{{....})))}.,)))))))))).)))){((({....,,|,,..{{{{{..........))}}}.,,}}}))(((((.((((....(((((((....)))),.}))..))))...)))))..)))))))..))}}))....,..)))))))
Forensic Context

No forensic context available.