Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0011700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PREX2_0115
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:69002814-69058587 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68090579-68146352 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-590.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -632.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 623.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((..((((((..(((((.((.............)).)))))(((((((((((((..((((...(((((......))))).))))..)))))...(((((.........))))).((.......))..)))))))).....((((((.....((((((...)))))).....))))))((((.((((((.....((((((((((.........))))))..))))...(((....)))....)))))).)))).................(((((...)))))...(((((((...((((......((((((((...))))).))).....((.(((((((......))))))).)).(((((((.(((((.......((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..)))))).....))))).)))..)))).((((((.....))))))(((((....))))).........(((.......)))(.((((((((((((...)))).......(((((..(((((((..((((.((.(((.....((.(((((((((((...((((.(((...((....))..))))))).....((((((.((((((..........))))))...............((((((...))))))......))))))..((((.((((.........)))).)))).....(((((((...........))))))).((((.((((.(((((....))))).))))..)))).)))))).))))).))....))).))))))..)))))))..)))))((((((((((......................))))))).)))((((((..((((((((.(((..(((((((((((.....((((..(((.((((................)))).)))..))))..))))).....))))))(((((((..((.(((.((((......)))).)).).)).)))))))......(((.(((((((((((.....((...((((........)))).)))))))...)))))))))....)))..)))))).....))..)))))).....((((((((......)).))))))..(((.((((..(.((...((((.(.(((((....(((.....)))....))))).))))).)).)..)))).)))....)))))))).).)))))))))))))))))..)))))))....(((.((..(((((((.....))).))))..)).))).(((.((......)))))....(((((...((((....))))....))))).....))))))).)((((.(((...........(((.(((((........))))))))((((((((((((((..((((((...((((.......))))..))))))..))).(((((((((((..(((((((.....))))).......((((((((((.........)))).))))))....))..)))..))))))))...((((((((...((((((...(((((((..(((((((.((.....((((.((((((...(((.((((.....))))))))))))).))))..(((((((((.(.((((.......((((...((((.....))))..)))))))).)))))))))).(((.((..((((...)))).)).)))......)).)))))))......)))))))....)).)))).....))))))))(((((........)))))....((((((((.((.(((((........))))).)).))...(((((((.......)))))))......((((((((........))).))))).......((((..(((..(((((........)))))...)))))))(((((((((...((....))...)))))))))...(((((((.(((((..((((((......))))...))..))))).).))))))))))))(((((((((..(((((((...............))))))))))))))))....)))))))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,(((((((({(,,(((((({{((((({(,..{{{{{{,...,}}.|}||,((((((((,,(((..((((...(((((......))))).))))..,||||...(((((.........))))).,,.,}}}..}},.)))))))).....((((((.....((((({...}))))).....}))))}((((.((((((.....{(((((((((.........))))))..)))|{,.{((....))).,,.)))))).))))......,...,,{{{|{(((((..,||}||..,({((((({{{{,{({{{{..({((((((...)))))},)).....((.(((((((......))))))).)}.(({{(((.(((((.......((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..)))))).....))))).)))..)))).((((((.....))))))(((((....))))).,,.,....,{{{{.....}},|||,|||||.||{,}}.)))}.......(((((..(((((((..(({{{((.(((.....((.(((((((((((...((({,(({...,{....}}..}}})))).{{{.{,,((({((,,,,.........}))))),..}}}..........((((((...)))))).,{{{{||,,|,{{((((({(((...,,{{{{||||..,,..,,..(((((((...........))))))).{{||}||||}||{,|}}}})),,,}))))},,,,,.)))))).))))).))....))).))))))..)))))))..)))))(((((((((({{............,.,..,,.})))))).))){{{,{{.,{,((((({.,,|},||||{{|||||}}}}}||((.,(((.(((,,,......,},..,}})))).))),.}}}}.,||,,}|,...})))))||{,,{|,.{{.|,|}||||}..,}.))))})).|,|,,||||||,......(((.(((((((((((.....,,...((((........)))).))))))}..,)))))))))....,,.}}))))),..}),....||||||,,...(((((({{......)}.))))))..{((.((((..{.((...((({,{.{((((....(({.....)))....))))).))))).)).}..)))).))}{{.,|.{{....))}}.)))))))))))))))..))))})),}}}((({(({{(.(({{{{,...||{,||||..}|{|||.(((,((.,,,..}}|||...{(((((,,.((((....)))}....|}}||,....}}}}}))|}||{{.(({,,{,(((((((,(({({,......}}}}.||{{{({....,||{,{((((,,((((((..,{{{{.......|}}},.}}}}}}..}}}|||(((((((,({{(.((((,.....||.||{{{.{{..(((({,,({.........)))).,))}))}}}.))..},.}})),)))),}}}}|||(({{...{{{{{{...,{{((((((((,{{,{,((.....{{{{,((((((...(((.,{({.,,,.}}))}))))))}).)))}..(((((((((.{.(((({.,,.,,((((,..{{{{,,,,,))}}}.}}}))))).)))))))))).{||,,|}}||||}},}))}.)),)))},.}..}},)))))))},,..,}))}}}}...,}},}})},....}}||}}||||,,{,}}}}|}})))}},.,}|||,|}||}|}}|||||}}},,,.})}}})}}}}))}}}(((((((.......))))))),,,,,,.,,,,|}|,.}.}}}})),.,))))})})),||||{,.|({,{((((|..}}},,,.}}},...}})))}}(((((((((.,.((....)).,.))))))))),{.((((((,.(((((.,{,((((......))))...}),.))))).,.))))))},....{{{{{(({{..{{{{{{{...,,,,,,,....,|||}||||}}}}}}}}..,}}}}})))|{|.,},.})))
Forensic Context

No forensic context available.