Basic Information
Symbol
hsa_chr8_0417000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PREX2_0182
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
8:69143591-69143938
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68231356-68231703
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-78.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-82.96 kcal/mol
Frequency:
0.0007
Diversity:
46.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((........((((.....(((((((((.((.((((((....)))..((((((.....)))))).........(((((.((((.((...((((((.....)))))).)).)))))))))..((((.((((((.(.((((..........(((....)))..........)))).).)))))).)))).))).)).)))))))))............((((((.......))))))))))....))))))).))))).(..(((........)))..)(((((((((((((.....))).....))))))))))......(((((((....)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((((((........((((.....(((((((((.((.((((((....)))..((((((.....))))))........,(((((.((((.((...((((((.....)))))).)).))))))))).,{(((.((((((.(.((((.....,....(((....}))..........)))).).)))))).)))}.))).)).)))))))))............((((((.......))))))))))....))))))).))))).(..(({.......,)))..}(((((((((((((.....))).....)))))))))}......(((((((....)))))))
Forensic Context
No forensic context available.