Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0067920 hsa_circPRKCI_001 hsa-PRKCI_0003
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:169953018-170002384 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170235230-170284596 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-286.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -312.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 349.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((.((.(((((((((((((((((((.((......)).))..........)))))))))))..)))))).)).)))...........(((((..(((...........)))..)))))...))(.((((((((......(((((..(((((.((.(..(((((((((.......((((.((((((((....((((.(.((...)).).))))((((((((.((((....(((((((........)))))))..((((......)))).(((((..((((((((((....((((..((((...((((((...)).))))...........)))).))))....)))))))...((((((.....)))))))))...)))))....))))))).))))).........(((((...((((.(((((..(((((((....(((.(((((..(((((((......)))))(.((((.....)))).)..((((((..(((((..((((((.....)))))))))))(((........)))((((((....((((...((((((((((((.((......(((((.((((((..........(((((..((..(((........))).))..)))))..)))).)).)))))......)).))))))).(((........))).)))))...))))......)))))))))))).................))..)))))))).......)))))))..))))).))))...)))))..(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))))))))))))))).))))(((.(((.((((((.....))))))))).)))((((((((.....(((((.(((((.(((...)))..)))))))))).....)))))))).....(((......(((((((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......)).)))))))))).))))...))))))))).).))))......))).)))))))))..).)).)))))))))).....)).)))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...(((.{(.((((((((((((((((({(.((.,....))))|,....,....)))))))))),.,)))))).}}.)))..........((((((.,(((.....,,....))),,))})}}}.))(.{{(((({{......(((((..(((((.{(.{..(((((((((......,{{{{.,((((((,....((((.{.,{...}}.}.)}))||||||{{.{{{,...{(((,{{({(((.{{(((({(|,..,{{{...,{,,|||,(({{{..|||(((((((..{{{{(({,((({...(({(((...))},)}},,....,,,,.}))).})))..,.)))))))...((((((.....))))))}}}...}}}))||,{{|||}}|}}}})|......,,,(({{{..,{{{{.{{{{{,,{{({{{{...,(({{{{{{{.,{,(((({......}))}||,{(({.....)))).,.{(,..(({,({(({.,((((((.....)))))})}}}}))).}}.,}.,|}||{{{|,.,|,||||,..{{{{||||,{{.,|,||||},|||||.,{|{{||||||,....,{{{{..{{..|||,,,,,...})},||.,}}))}.,||||||},|||||||||}}})}}}))}}}||{{........})}.}}}})|}}),}|||,,..}}}}}})})),|{{{{..........))}))..}||}}|||,|....,))))}}}..})})),))}}...}}}}},.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).,.....})))))))))))))))}))}}}|}}}|(((.(({{((((((.....))))))))).})|((((((((.....(((((.(((({.(((...)))..}))))))))).,...)))))))),....|||,,.,,.,{,(({{((,{{{,,,||||||||...},|})).))..((((((((((((......))))))))))))).,}))},,))},,))))}))),))})}.}.)))})))))))))..}.)).)))))))))).....}}.))))}}.)
Forensic Context

No forensic context available.