Basic Information
Symbol
hsa_PRKCI_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0067921
hsa_circPRKCI_002
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:169953018-170009729
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170235230-170291941
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-310.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-336.59 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
420.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((.(((.....))).)))...)))((((((((((..(((((((......))))))).......((((((..(((.(..(.......(((((((((......(((((.(((((..(((((.........(((.(((..((((..(((((((.((((....)))).))))))))))).........))).)))..)))))..))))).))))).((((((.((((((..(((((.((.((((..((((.(((.........))).....(((((..((((((((((....((((..((((...((((((...)).))))...........)))).))))....)))))))...((((((.....)))))))))...)))))))))..)).)))).))))).....((((.....))))...)).)))).))))))..(..(((..(((((.(((...(((((((((((..((..(((.(((....((...(((.(((((..((((((.....)))))))))))))).))..))).)))..))...)))))))......))))....)))))))))))..)....)))))))))....)..)))).))))))((((....(((((....(((((...(((((((.(((((((((...((((((.((((........)))...).)))))).(((((.......))))).(((((..........))))).......(((((....)))))........((((...((((((.((.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))))))))).))))))))))(((.(((.((((((.....))))))))).)))((((((((.....(((((.(((((.(((...)))..)))))))))).....)))))))).....)))))))))(((((((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......)).)))))))))).))))...))))))))).).))))....))))))).))))))))))..................((((.((((((...((((.(((.((.(((((.............))))))).))).))))..))))))))))))))........))))))))......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(....}(((((({(((((((((((((((({(.((,,....))})|,....,....)))))))))),.,)))))},.,,{{,...,|,,...{(((((.{(((...,}}}....}))}})}}}|||..{|{{{|.,,{{..,.,,{{({{.,(((((.{{,{..{((((((({,{{...}||||,,{(({((,.,,,{{{{,|.,|.,,}}.}.}|||||||||{{.{{{{...{(((|||({(((,{{(((({({,..,{,{...,|,,|||.(((((..(({(((((((..{{{{((,,((({...(({(((...))},))}.,....,,,,.}))).))))..,.)))))))...((((((.....))))))}}}...}})))}}}|||||}},}}|})|,,....,,{(({{,..||||,.{{|||},|{{{{{{,..,({{({{,{{,,{,((({,..,,,.|}}|||,{(({.,,,.})}}.,.{{,..{{{,{{(({.,((((((.....)))))})}}}}))}.}}.,},,}}}|,,||,.,|}||||,..{{{{||||,{{.,|,||||}}|||||.,,||||||||,.....|||||..,,..|||,}},,,..|||{|,..}||||,.,,{|{||{|||||||||||,}}||||||,{{({........})}.}}}|)}}}),}|{|{{..,,|}|}}})},{{{{{..........))}})..}||,||||,{....|})))},}..,},)}|}}}},,,|||}||.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).,.....})))))))))))))))})))))})}}}(((.(({{((((((.....))))))))).))|((((((((.....(((((.(((({.(((...)))..}))))))))).,...)))))))),....|}}}}}}},{{{((((((,{{{{,{{||{{{{{...,.,))).))..((((((((((((......))))))))))))).,))),..)))},)))),)}}})),},.),)))})}))))))),,}.}}.}))))))))),,,,||{{.((((((...((((.(((.({{(((((...,.....,...})))))).))).))))..))))))}}|((((...........)))))...))))))
Forensic Context
No forensic context available.