Basic Information
Symbol
hsa_PRKCI_0008200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0122681
hsa_circPRKCI_013
hsa-PRKCI_0005
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:170002249-170016898
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170284461-170299110
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-154.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-169.44 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
183.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.((((.((...(((((((.....((((((((((((......)).))))))))))...))).))))..(((((((...(((((.((((((..(((((((........((..((.((.((.....)))).))..))......)))).((((.(((.(((......((((((.(((.(((((((((((((.(((((...........))))).(((...((((....(((((..((((((((...(((((((.((((.((.(.(((((..(((......)))..))))).).))...)))).)))))))...)))..))))))))))((((......))))((((((....))))))...............))))...))).....((((.....))))((.(((((...(((....)))....))))).))..((((.((.(((((.((((((((.....)))))...((((...)))).)))))))).))))))..)))).)))))))))))).))))))........))).))).)))).((((((((((((...........)))))))))))).........)))..)))))).)))))....)))))))....)).)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,((,.{{((,(({..,,,,{||.,,..((((((((((((......)))))))))))))..}))))||||..(((((((...(((((.((((((..(({((((..,,,,..{(,,((,,{.{{,....}))}.})..}},,,,,.)))).((((.(((.(((.,....{(((((.(((.(((((((((((((.(((((...........}}}||,{,,...{{{{.||.(((({..((((((((.,.(((((((.((((.,,.{.(((((..(((......)))..))))).}.,,...)))).))))))).,.)))..)))))})))),((({.....}}}|((((((....))))))}..............}}}}.,,}}},},|,|{{|...,.}))}{{.(((((..,(({...,))}....))))).}}..((((.((.(((({{((({{(((....,}})}}...((({...}))).)))))))).))))))..}))),,))))))))))).))))))......,.))).))).)))).((((((((((({.{{{{...})))))))))))))).........}))..)))))}.)))))....))))))).,,,}),)))}}},...
Forensic Context
No forensic context available.