Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0000900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0087
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:169953018-170016898 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170235230-170299110 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-427.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -462.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 537.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((....(((((((((((((((((((.((......)).))..........)))))))))))..))))))..((((....))))....((((((((((...)))).....)))))).((((((((.(((....(((((((((((...(((((.((((....)))).)))))(((((((...((((((.....((((.(.((...)).).))))))))))...((((......))))(((((.(((((((((((.((((((((((....(((.....)))(((((((....((((..((((...((((((...)).))))...........)))).))))....)))))))...((((((.....))))))........((((((((((((((((((((.....(((......)))......)))))))......((((((((((...(((.(((((......)))))(.((((.....)))).).((((..(.((.((..(((((.((((.............)))))))))..))..)).)..)))).....((((...((.((....)).)).)))).....(((((...................))))))))...)))))...))))).....)))))))))))))))))))..)))).)))).((((........((((((((..(((((.......))))).(((((..........))))).......(((((....)))))........((((...((((((.((.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))))))))).))))))))))(((.(((.((((((.....))))))))).)))((((((((.....(((((.(((((.(((...)))..)))))))))).....)))))))).))))))))........)))).((((((........))))))(((((.....((((((((((((......)).))))))))))...)))))......))))))).))))).....(((((((.((((.(((((....((((((..((.(((.((((((...((((.(((.((.(((((.............))))))).))).))))..)))))))))((((...........))))..........)).)))))).....))))))))).)))))))))))))).)))))))))))))).)..)))))))...))))))).(((((((....((((((((((.........))).)).)))))..(((((((....))))))).............((((((((((((((((((((.....))))...(((((..((.(((((.......))))).))..)))))((.(((((.((((((((.....)))))...((((...)))).)))))))).))((((((........))))))...)))))))....)))..)))))).)))))...............(((((((....(((.(((((((....(((...)))(((((....))))).))))))).))))))))))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((((((.,,.{(((((((((((((((({(.((.,....))))|.....,....))))))))))}.,)))))).,,,{|....|},....,(({(({((((...})))...,,})))}}.((((((((.(((....(((((((((({..{(((((.((((....)))).)))))|{(((((,..((((((.....((((.{.,{...}}.}.))))))))))...((((......}))}(((((.((((((((,,..,{{{.,,{{,.|||,(({{{..|||(((((((..{{{{(({,((({...(({(((...))},)}},,,..,.,,,.}))).})))..,.)))))))...((((((.....))))))}}}...}}}})|||{{{|{,,,}}||||.,....,,{(({{,.,|{||,.{{||||}|{{{{{{,..,(((({{,,,.,{{((({{......}))}}|,|{{{.,,,.}))}.,.|{,,.{{|,{{(({.{((((((.....}))))})}}}|}}|.}}.,}..}}||{{||,.,,|||||,.,{{{{{{|{{{{,,|,|||||||||{{.,,{{{{{{,,,.....,,{{{..,,..|||}},.,...}||||}..}||||,,|,|||||,|}|||||||||,}}||||||,|{({........}}}.,|||}|||},}|{{{{..,,|}|})})),{{{{{..........)))))..}||,||||,{....|))))},}..,},}}|}}}},,,|||}||.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).,.....}})))))))))))}})}}}||||||||(((.(({{((((((.....))))))))}.}}|((((((((.....(((((.(((({.(((...)))..}))))))))).,...)))))))),.,,,}}}},,,},.,.{({{(({,,,,..}}}|||||,.,||||||,}}..((((((((((((......))))))))))))).,}))}}}}},..)))))))).))))}...,,{(((({(,((((.({{{{..,.((((((,.{{,{({.((((((...{(((.{((.({{(((((.,.,.....,...}}})))).))).))))..)))))}}}|((((...........))))}.......,})}.)))))).....))))))))).))))))))))))},.}))))))))))))).)..)))))))...}}}}})),(((,,.((((((((({(((....(((((((({((({.,..,)}}|((((((....))))))}..........,.......,|,,,,,}}}.{{{{.....}))}.}))))))).{{,{,,,||||....,}}}|.,}..||||,{{.{||||||||{((((.....))))}...{{({...}))),))}}||}|.|}}|||...,,|,,...,))),}}}..})))))....,,,{||||.,,}}}},,.....,,.......(((((((....{((,(((((((....{{,...,}}{{{{,....})))}.))))))),))))))))))...}))
Forensic Context

No forensic context available.