Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0090
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:169975548-169976714 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170257760-170258926 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-371.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -391.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 254.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.