Basic Information
Symbol
hsa_PRKCI_0003500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0034
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:169977757-170016898
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170259969-170299110
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-394.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-426.89 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
541.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(((....(((((((((((...(((((.((((....)))).)))))(((((((...((((((.....((((.(.((...)).).))))))))))...((((......))))(((((.(((((((((((.((((((((((....(((.....)))(((((((....((((..((((...((((((...)).))))...........)))).))))....)))))))...((((((.....))))))........((((((((((((((((((((.....(((......)))......)))))))......((((((((((...(((.(((((......)))))(.((((.....)))).).((((..(.((.((..(((((.((((.............)))))))))..))..)).)..)))).....((((...((.((....)).)).)))).....(((((...................))))))))...)))))...))))).....)))))))))))))))))))..)))).)))).((((........((((((((..(((((.......))))).(((((..........))))).......(((((....)))))........((((...((((((.((.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))))))))).))))))))))(((.(((.((((((.....))))))))).)))((((((((.....(((((.(((((.(((...)))..)))))))))).....)))))))).))))))))........)))).((((((........))))))(((((.....((((((((((((......)).))))))))))...)))))......))))))).))))).....(((((((.((((.(((((....((((((..((.(((.((((((...((((.(((.((.(((((.............))))))).))).))))..)))))))))((((...........))))..........)).)))))).....))))))))).)))))))))))))).)))))))))))))).)..))))))((((((.....(((((..(((((((((((((.(((.(((((..((((......))))((((((....))))))....................)))))..)))((((.....))))..((((((..((.(((((.......))))).))..))))))...))))))))(((((.....)))))((.((((...)))).))..((((.((..(......)..)).)))).......)))))....((((((((......))((((((((((((...........))))))))))))............(((.........))))))))))))))......))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.(((....(((((((((({.,{(((((.((((....)))}.})))}|{(((((,..((((((...,,((((.{.,{...}}.}.}}}}}})))},..((((....,,||}|({(((.{{(((({({,..,{,{...||,,|||,(({{{..|||(((((((..{{{{(({,((({...(({(((...))},)}},,,....,,,.}))).})))..,.)))))))...((((((.....))))))}}}...}}}))|||{{{||,,,}}|}}|,,....,,{(({{,.,||||,.{{||||}|{{{|{{|..,(((({{,,,.,{{((({{...,..}))}}|,{({{.,,,.)))).,.|{|,.{{|,||(({.{((((((.....)))))})}}}||||.}}.,}..}}||{{||,..,|||||,.,{{{{|{,|{{{,,|,||||}}|||||.,||{{||||,,.....,,|||..,,..|||||,.,...}||{||..}||||,,|,|||||,|||||||||||,}}||||||,|{({........}}}.}|||}||}},}||||,..,,|}|}}})),|{{{{..........))}})..}||,||||,{....|))))},}..,},)}|}}}},,,|||}||.{((((,..(((((((((.((((((.(......).)))))).,.....}})))))))}}}}}}}|}|||||||||(((.(({{((((((.....))))))))}.}}|((((((((.....(((((.({(({.(((...}))..}))))))))).}...))))))))},,,,}}}},,}},,,,(({{(({,,,,,,|}||||||..,||||||,}}..((((((((((((......))))))))))))).,}))}}}}},..))))}))},))}}}...,,{(((({{,((((.{{{{{..,.((((({,.{{,{({.{(((({...{{{{.{{(.(||(((((.,.,.....,...}}})))).))).))))..}))))}}}|((((...........))))}.......,})}.)))))).....))))))})).))))))}))))}},.}))))))))))))).)..))))))((((((.....(((((,.(((((({((,(((....(((((((({((({....,)}}|((((((....))))))}..........,,.......},,.,,}}}.{|||....,)))}.)))))))).{{{{,,|||||....}}}},.,,..||||.{{.|||||||||{{(((....,)})}}.,.{{{{...}))),))}}||}|.|}}}|}.....},,...,))).}}}..})))))....{((((({{.....,)}{(((((((((({.,{({...})})))))))))))}.,....,{,...|||},,......,,})))))))))))....,,))))))....
Forensic Context
No forensic context available.