Basic Information
Symbol
hsa_PRKCI_0004100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0086
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:169981167-170002384
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170263379-170284596
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-236.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-254.74 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
242.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((((.((((......))))((((((((((...(((.........))).(((.(((((..((((((((((....((((..((((...((((((...)).))))...........)))).))))....)))))))...((((((.....)))))))))...))))))))(((((...)))))...))))).)))))...(((...(((((..(((((.....(..(((..(((((.(((...(((((((((((..((..(((.(((....((...(((.(((((..((((((.....)))))))))))))).))..))).)))..))...)))))))......))))....)))))))))))..)......)))))....))))))))....)))).)))))).(((((....(((((...(((((((.(((((((((...((((((.((((........)))...).)))))).(((((.......))))).(((((..........))))).......(((((....)))))........((((...((((((.((.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))))))))).))))))))))(((.(((.((((((.....))))))))).)))((((((((.....(((((.(((((.(((...)))..)))))))))).....)))))))).....)))))))))(((((((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......)).)))))))))).))))...))))))))).).))))....))))))).))))))))))........))((.((.((.....)))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({(((((.((((.((((......)))),,(((((((((({((...,,,,...,|,,|||.(((((..((((((((((..{{{{((,,((({...((((((...))},))}.,....,,,,.}))).))))..,.)))))))...((((((.....)))))))))...)))))}},}|}))}},||{|||.....||{|||,,.,,|||,..{||||}}|((((.,...{,,((,.,{((((.(((...{{{{{{{{{{{.{(({.,{,.|||}.,.((...(((.(((({.,((((((.....)))))}))))}))).)).,},,,},,..}}...}))}}},.....,))}}.,..}))))))))))..}...}},))))}.....,)))))}....)))).)))))}.(((((....(((((...(((((((.(((((((((..,{{{(((.((((........}},.}}},}}}}}}.((({(....,..})))}.{{{{{..........)))}},.,{{.,{(({{..,,|||}|......,.|||||.,{{{|{|,||.(((((,..(((((((((.((((((.(......).)))))).,,....}))))))))))))))),))})))))}}(((.(({{((((((.....))))))))).))|((((((((.....(((((.(((({.(((...)))..}))))))))).,...)))))))),....)))))))))(((((((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......))))))))))))).})))...))))))))).)}})))....))))))).))))))))))........))((.,(.((,....)))}.))
Forensic Context
No forensic context available.