Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0004200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0079
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:169981167-170015181 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170263379-170297393 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-346.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -373.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 446.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.((((((..(((((.((.((((..((((.(((.........))).....(((((..((((((((((....((((..((((...((((((...)).))))...........)))).))))....)))))))...((((((.....)))))))))...)))))))))..)).)))).))))).....((((.....))))...)).)))).))))))..(((.(........).)))...(((((((.(((((((.....))))...((...(((.(((((..((((((.....)))))))))))))).))....((((((((.........(((((((((..(((((.(.(((((((.......((((((...................)))))).....(((((....(((((...(((((((.(((((((((...((((((.((((........)))...).)))))).(((((.......))))).(((((..........))))).......(((((....)))))........((((...((((((.((.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))))))))).))))))))))(((.(((.((((((.....))))))))).)))((((((((.....(((((.(((((.(((...)))..)))))))))).....)))))))).....)))))))))(((((((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......)).)))))))))).))))...))))))))).).))))....))))))).))))))))))..))))))).))))))..((((.((((((...((((.(((.((.(((((.............))))))).))).))))..))))))))))..(((((((.(((..........))).)))))))(((((..((((((((...(((((((.((((.((.(.(((((..(((......)))..))))).).))...)))).)))))))...)))..)))))))))).)))))))))...(((((((....)))))))........................))))))))...((((.(((.((((((..((.(((((.......))))).))..)))))).)))))))...(((((.....)))))..))).)))))))))))))(..((..((((((........)))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(((({(,(((.(((...(((((((({(,{(,,((((,(({..,{,,...}}},|||.(((((..((((((((((..{{{{((,,((({...((((((...))},))}......,,,,.}))).))))..,.)))))))...((((((.....)))))))))...)))))}}}|||||,,,}}|})|,,.....,,(((({..,({{,.{({{(,,{{{{{{{,..,(({{{{{,,..,{{((({......}))}|||(({{,,,,,})}}.|.{(,,.{({,({(({.,((((((.....)))))})}}}}))).}}.,}.,|}|{({{{{.,{,{,{{,.,(((({{,{{((,.{.||{||,|||{{.,{{{{{({,,,.....,,{{{..,,..|||}},.....}||||}..|||||{,{|{{{|,.||||||||,,||}|||||}}||(({........}}}.,}}}},,})}}}||.,..}}}}}))}}),|{{{{..........)))))..}}}}}|||,|....,))))}}}..}}))),}))),,.})))}.|||||||...,,|||||{.((((((.(......).)))))),|}.(((((((((((.((((((((((((({,(((((({{{{{((((((.....))))))))}...,,((((((({{{.....|}}||||}}}|({{{{.....))))),,)))))))..,,|{(((((((,.{{..(((((((,.(((.((((((...(((((..,,,{{||.,,..((((((((((((......)))))))))))))..,))}},|||{{{{{{.{{(((({....,{{{{{{{,,.((((.,.,{,..{{{.((,{{,{{,,,,.||||,|}..||||,||,}}}}{{{{|.,,,.,,{{,......}))),))},)))}..,))))))){{(((...........))))}.......,})}}))}(((({..((((((((.,.(((((((.((((.,,.{.(((((..(((......)))..))))}.}.,,...)))).))))))).,.)))..)))))})))),({(|.,..,))}|((((((....))))))}..........,....,,,.},},)))))..)))))}.))),..}))))))..}))))))))))))))))))....)))))..)))))))}})))})})))}..)))))).,.))).))).))))))))(.,({,,{{(({{......,.}))))).,,)
Forensic Context

No forensic context available.