Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0005500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0065
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
3:169988209-170003674 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170270421-170285886 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-537.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -578.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 550.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((..((((((.....))))))......(((((.(.((((...(((((((.....(((......)))......)))))))...))))...).)))))(((((.(((...(((((((((((..((..(((.(((....((...(((.(((((..((((((.....)))))))))))))).))..))).)))..))...)))))))......))))....))))))))((((....((((...((((((((((((((((((....(((((((.(((((....(((((...(((((((.(((((((((...((((((.((((........)))...).)))))).(((((.......))))).(((((..........))))).......(((((....)))))........((((...((((((.((.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))))))))).))))))))))(((.(((.((((((.....))))))))).)))((((((((.....(((((.(((((.(((...)))..)))))))))).....)))))))).....)))))))))(((((((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......)).)))))))))).))))...))))))))).).))))....))))))).))))))))))........(((((.(....))).)))....(((((((.((((((((((((((((((((((......(((((.(((((((((((.........((((((........))))))))).))))))))...)))))......)))...(((((((.........))))))).((((((...............)))))).((((..(((..((((((.((((((((((.((....(((((.....)))))..)).)))))))))).....((((((((.((........(((((.(((((((((........))))))))).))))).(((((((............(((.(........).)))............))))))).............)).))))))))......))))))....)))..))))(((((((((.....((((.(((..((((((...(((((((((...((((((..............((((.(((....)))))))....................((((((((...))))))))((((((((((.((.((((((((((((((.(((...((.((.......)))).)))))))).))))).....))))))))))))......((((((((......(((....)))......)))))))).((((((...........))))))))))......((((.....(((((.(((....))))))))....))))..........((((((((.....)).))))))....(((((((((....)))))))))......)))))).))))))))).))))))..)))))))....)))))))))............(((.....)))(((((((...))))))))))))))))))))...)))))).)))))))...(((((.(((((.............))).)).))))).))))))).(((..((((((((((((((((((...)))))).........((((((......)))))).....(((.(((((.....((((((((..(((((.....(((...))).....)))))....)))))))).....))))).)))(((......)))............))))))))))))))).................))))))))))))))))))(((((((((((...)))))))).)))(((((((((...((((((..(((((.(((..............)))....)))))...)))))))))))))))))))..)))))))))((.......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,{,{,.((((((.....)))))).{{,,...||||{{(((((,..||||((,.......{(((({{(({,,.,,((((({{.,..{{{{{{{{{{......,,{((({,...,..})))}|,||||,}}},})}}.,,|||..|||}|||||.{((((((.....})))))),,,||||,,},}},.}}},,..,...,|},,,,.,||}}}}|,,}}.,}})}}}||}||,,.,|}}|}}}((((((((((((((((((,...(((((({.,(((((.((((((.{{.((((.((((((...}))))}.)))}...(((........))).)}.)))))).))))},,({{(,(((,{{,.,,,.......}}},)}},}},}||.{(((((...,|||}|......,.}}||{(({.{(((.((((((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).,.....}))))))))}}},,}},,{(((((((((,{{(({(((((((.....)))))))}}.,,{((((((((.....(((((.(((({.(((...)))..}))))))))).,...))))))))}....||....,},...{({{(((......))))))}},..)))))))))}....,||))).}})}.}))))}(((|{{{||.{(((.((((((((.((((((,{(,((((((((.(((((((((((........((((((...{((,....})),..)))))){(,,,,,,}}.,,,,..}}},,..))))))))).))))))))))|.||||.......,,,,(({({{,,,,,{((((({{.((,{((.{(((((((.,,..,{{....,(((((((.........))))))).,,,,.|},..............}}},)))))))}.)))})......((((((((((.,,.,,.(((((.....})))).,)}.)))))))))).....{(((((({.{{,,......{((((.(((((((((........))))))))).))))}.(((((((.....,,,....{{(.{........,.}}}...,}}......))))))).............}}.)))))))}}})))))},,.||.,,},}},,,,,,....,}},..,,,||||,||||,{{,,,,.{{((.(((((((((((((({,,{{{({{(({{..((({.{((....}}}}}},..................|.((((((((...)))))))).,..((((({{((.(((((((((((((({(((,..((,{{..,,...)))}.}})))))).))))).....))))))))))))...}}}||||||||....,,(((,...}}}.....,)}}}}}}}.{{((((.,,....}),})))}}}}}}},.....{{{(..,..(((((.(((....}))))))).|..}}}),,.,}}}}}.({((((((.....)).))))))....(((((((((....)))))))))......}))),..))))))))))).)))).,))})))}))))))))))).)))},.,,..}}}{((.....))){((((({...})))))},..||,}},}}}},,,.,}}})}))}(((((((,,.{(((........))))}}...))))))),,,}),))))))),||,..((((((((((((((((((...)))))).........((((((......))))))..,,,(((.(((((.....((((((((..(((((.....(((...})).,...)))))....)))))))).....))))).))}||{......)}}..,.........)))))))))))),||,..,,,.....,,,.,,)))))))))))))))))}(((((((((((...)))))))).))){(((,((((((((.((((.((....}))).)).))))..)))))))}})}})}))}}})),,,}}})}}},((((((.......,..)))))).....}
Forensic Context

No forensic context available.