Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0005700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0062
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:169988209-170016898 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170270421-170299110 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-328.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -353.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 452.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.....((((((.....))))))......(((((.(.((((...(((((((.....(((......)))......)))))))...))))...).))))).))((((((.....((((((.(((((((.....))))...((...(((.(((((..((((((.....)))))))))))))).))....((((((((.........(((((((((..(((((.(.(((((((.......((((((...................)))))).....(((((....(((((...(((((((.(((((((((...((((((.((((........)))...).)))))).(((((.......))))).(((((..........))))).......(((((....)))))........((((...((((((.((.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))))))))).))))))))))(((.(((.((((((.....))))))))).)))((((((((.....(((((.(((((.(((...)))..)))))))))).....)))))))).....)))))))))(((((((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......)).)))))))))).))))...))))))))).).))))....))))))).))))))))))..))))))).))))))..((((.((((((...((((.(((.((.(((((.............))))))).))).))))..))))))))))..(((((((.(((..........))).)))))))(((((..((((((((...(((((((.((((.((.(.(((((..(((......)))..))))).).))...)))).)))))))...)))..)))))))))).)))))))))...(((((((....)))))))........................))))))))...((((.(((.((((((..((.(((((.......))))).))..)))))).)))))))...(((((.....)))))..))).))))))(((((((((.(((.(((((..(((((......)))))..)))))....))).)))).....)))))..............(((((((....(((.(((((((....(((...)))(((((....))))).))))))).))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((,.,,.((((((.....))))))...},.{{{{(,{,((((,,.(((((((.....{{(,,,...}}),,,...})))))),,.}}}}.,,).))}}}.,}((((((...,{(,,,(({(((((((.....)))),{,((,..(({,(((({.,((((((.....)))))})}}}}))).}}.}}..||{{{{{,..,||{,.,,,{({({{,.{{(({.|.||{|{{{|,{,..,{(({({........,,,,,..,,..|||}},.....|||{|,..}||||(,{{((((,,,{((((((,,(,,{((((,,{(((,.,.,,,,,|,...,|,},}}},,{||,{....|,||}}}},{{{{{.......,,.)))}),.||{.,(((((....})))).......,)))|,}}}}|,}}},,}|||||}..,||||||||.{{{{{{.{..,,,.}.||||||{{..{{{||||||||,|||||||{||||||,||{(((,(({{((((((.....))))))))).,,|{(((((((,{,..,{,||}|||||}||({,,|,,..,)))))}}))})}}},}}}}|||{{{{,}}||,,|||(((({{(((.((((((,,{(((((.....,|||.}}..((((((((((((......))))))))))))).,}))},,}}}||||||.|{{|||,...}}|||||,|}},||||,}.,||,,|||.||}|||,,{{{,.||||{|,..||||,||,}||}{((((.,,,...,,,...,,,}))),))),))))..,)))))))||(((...........)))}}..,.,,,,})}}}},(((({..((((((((.,.(((((((.((((.,,.{.(((((..(((......)))..))))).}.,,...)))).))))))).,.)))..)))))})))),{{(|,,,.,)}}|((((((....))))))}...............,,,.}}},})))),,))}}},.}}}|,.}}|||||..||}|}}}}}}}}}}})))),.,,}}))),.}}}))|||||||,|,||}}}}})})},.}}}}|,...}}||{||||||,{{|,{{(({..(((((...,,,)))))..})))}....,}).)))).....)))}|,,{{{{{{{{,.,{{{,,,||,}}}}}}}}||||{{...,||,,,,,}}{{{{,....}}))},)))))}))))))},))),))))))
Forensic Context

No forensic context available.