Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0006700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0100
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:169991074-170013778 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170273286-170295990 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-229.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -247.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 172.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(((((..((((((.....))))))))))))))....(((((((((((.........(((((((((..(((((.(.(((((((.......((((((...................)))))).....(((((....(((((...(((((((.(((((((((...((((((.((((........)))...).)))))).(((((.......))))).(((((..........))))).......(((((....)))))........((((...((((((.((.(((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))))))))).))))))))))(((.(((.((((((.....))))))))).)))((((((((.....(((((.(((((.(((...)))..)))))))))).....)))))))).....)))))))))(((((((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......)).)))))))))).))))...))))))))).).))))....))))))).))))))))))..))))))).))))))..((((.((((((...((((.(((.((.(((((.............))))))).))).))))..))))))))))..(((((((.(((..........))).)))))))(((((..((((((((...(((((((.((((.((.(.(((((..(((......)))..))))).).))...)))).)))))))...)))..)))))))))).)))))))))...(((((((....)))))))........................)))))))).......)))...))))(...(((....))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(((.(((((..((((((.....))))))))))))))..,.,{{((((((((..,..,,,.{(((((((({.(((((.(.(((((((,......{(((((...................)))))}.....(((((....(((((...(((((((.(((((((((...((((((.((((........}},.|}}.})))}}.(((((.......})))}.,{{{{........,.)))}},.,{{.,{(({(..,,|||}|......,.|||||.,{{{{{|.||.(((((,..(((((((((.((((((.(......).)))))).,,....}))))))))))))))),)))))))))}{((.(({{((((((.....))))))))).))}((((((((.....(((((.(((({.(((...)))..}))))))))).,...)))))))),....)))))))))(((((((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......))))))))))))).})))...))))))))).),,)))....))))))).)))))))))).,))))))).))))))..{(((.((((((...((((.(((.(,,(((((...,.....,...})))))).))).))))..)))))))))|{((,,,........}}},},,},}))}}),,}}.(((((..((((((((...(((((((.((((.,,.{.(((((..(((......)))..))))).}.,,...)))).)))))))...)))..)))))))))).||||}}},},,,{((((((....))))))}...................,.,..))))))))....,,|},,.,.})}){...{{|...,)}}.....)
Forensic Context

No forensic context available.