Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0006900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0084
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
3:169998015-170003674 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170280227-170285886 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-468.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -504.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 396.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((..((((((....(((((.((((((.((.((((.((((((...)))))).))))...(((........))).)).)))))).)))))((((((.(((((..(((((..........))))).......(((((....)))))......((((..((((..((((..((((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).......)))))))))...((((.(((((..(((((((..((((((((.....))))))))......((((((((((.....))).)))))))(((((.....)))))..)))))))))))).))))...(((((((...(((.((((.((((((((((((((......))).))..((((((((((((......)).)))))))))).))))...)))))))))((((.(.((((((((.(((((((((((........((((((...((((.....)))).))))))(((....)))..............))))))))).))))))))))).))))........((((..(((.((((((((((...(((.((.((((((((.............(((((((.........)))))))..(((((...............))))))))))))).)))))......((((((((((.((....(((((.....)))))..)).)))))))))))))))))))).)))..))))....(((((.(((((((((........))))))))).))))).(((((((............(((.(........).)))............)))))))...........)))..)))))))...))))))...))))))))..))))..................((((((((((((((.....((((((..........(((((((((...((((.(((((..(((((......................((((((((...))))))))((((((((((.((.((((((((((((((.(((...((.((.......)))).)))))))).))))).....))))))))))))......((((((((......(((....)))......)))))))).((((((...........))))))))))......((((.....(((((.(((....))))))))....))))..........((((((((.....)).))))))....(((((((((....))))))))).............((((.((......)).))))............)))))...))))).))))(((.....)))(((((((...)))))))....))))))))).......))))))(((((((...((((........)))).....)))))))...((((((((...........))).)))))((((((...)))))).........((((((......)))))).....(((.(((((.....((((((((..(((((.....(((...))).....)))))....)))))))).....))))).)))))).))))))).))))..))))).))))))...((((((((.(((.....))).))))).)))..........((((((((((((...)))))))).))))(((.((((((((.((((.((....)))).)).))))..))))))))))))).)))).))(..((((.(((..(..........)..)))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((((..((((({....{((((.((((((.{(.((((.((((((...)))))}.)))}...(((........))).)}.)))))).))))|((((((.(((((,,({{{{........,.}}}}}.,,{{.,(((((....|||}|,.,,..,,|,{{((({.,((({,,((((((...(((((((((.((((((.(......).)))))).,.....}))))))))...,,||,|{((({{(((({({(({(((((((.....))))))))}.,,{((((((((.,...{{{((,{{{{|,{((,..}}}..,))))))))),},,,)))))))))....{{{{{{{...,,({{((({,,,,,,||||||||...}}}))),)),.{{{{{{|||{||,...,,)))|||}}}}}}}.|||}{{{|||||,|||((({.(.((((((((.(((((((((((........((((((...((({....}))}..)))))){{{,,,.,,,.......,}},...))))))))).))))))))))}.}))}........{{{({,({{.{{{|((((((,,.((,{((.{(((((((.,,..{{{....,(((((((.........))))))).,.,,.}},..............}}}.)))))))}.)))))......((((((((((.,,.,,.(((((.....})))).,)}.)))))))))),,}},|||||{||}{,}},,....(((((.(((((((((........))))))))).))))).(((((((.....,,,....{{(.{........,.})}...,}}......)))))))...........,,},.))))))),,,))))))...}}}}}}}},,}}}|.....,,,...,,,,,..{((((((((((({(.,,.{((((((,,,,.,,...(((((((((...((((.((({{..{||{|....................,.((((((((...)))))))){{,,((((({{((.(((((((((((((({(((,..((,{{..,,...)))}.}})))))).))))).....))))))))))))...,..((((((((......(((....)))......)))))))).{{((((.,,....}).}))))}}}}}}......{{{(..,..(((((.(((....}))))))),}..}}}),,,.,}}}}.({((((((.....}).))))))....(((((((((....))))))))).......,,,.,.||||,||,,,,.,)),,})},}},.,}}},,,))))},,,))})}.})))(((.....))){((((({...})))))}....})})))))}.......))))))(((((((,,.{(((........))))}}...)))))))...((((((((...........)))}}})))((((((...)))))).........((((((......))))))..,|{({{.{{|||,,...((((((((..(((((.....(((...))).,...)))))....)))))))).....})))),)))))))))))))).}})),.,)))).)))))),..{{((((((.(((.....))).)))))}})}..........{(((((((((((...)))))))).)))}(((.((((((((.((((.((....)))).)).))))..))))))))))))).)))).))(..((({{(((..(..........)..)))))))....)
Forensic Context

No forensic context available.