Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0009000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0066
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:170009000-170009569 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170291212-170291781 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-157.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -169.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((...........)))).)((((((((((..(((((((((..........((((((((.......))))))))(((((....((((....))))....))))).................................))))))).))...))))(((((((.((((.(((((((.((((..((........))..))))))))(((((((((....)))))))))...((((((....))))))....((((((((.(..(((((((.(((((((.............)))))))..)).)))))..)))))))))..................((((((((......(((....)))......))))))))(((((....))))).)))..)))).)))))))((((((...(((....(((((((.((.........)))))))))..))).)))))).(((((.........))))).............((((....((((.((((...((((((((((((....))))))..)))))))))).))))....)))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({({((....{{(.((....{(((.....)))}...}}|||..,.,.......,(({{{{((,,,,,,,}}}}}}}}{((((.,,.((((....)))).,,.)))))..,.|{{,..,,|,,....{{{.,,......},,.,)))|{{{{{{{,{,{((((((.{(((.{{(((({.((((..{({{,....,))},))))}}))(((((((((....))))))))}...((((({....}))))),|..((((((((.(..((((({{.(((((((.............)))))))..},.)))))..)))))))))..,,..............((((((((..,,..(((....)))......})))))))(((((....))))).}}}..)))}.)))))},((((((...(((....(((((((.((,,....,,.)))))))))..))).)))))).{{{{{.|.,,,,,,))))).............,,,,....||||.{{({...((((((((((((....)))))}.,}))))))))}.))))..,,}}}},}})}))
Forensic Context

No forensic context available.