Basic Information

Symbol
hsa_PRKCI_0010100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRKCI_0061
Host gene
PRKCI
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:170011297-170013658 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:170293509-170295870 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-883.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -924.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 590.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((((((((.(((((...))))).))))....))))))))).)))(...((..(((.((((..(((((......)))))......)))))))..)).....(((((...((.....))..))))).(((((((..(((.(((((.(((.(((((((((...((.((...(((.(((((((((.((((((((((.((.((((((.((((((..((((......(((((((.((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...((((.(((((..((((((((((((....(.((((.((((((((((((.((((.((((((((((((((((.((((....((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((.....(((((.(((((((((..((((((((((..(((((.....((((((((((((((..(((.((((..((.((((((((((((((...((((((.....(((((...(((..(((((((((((...........(((((..............((((((.......)).)))).........((((((..((((((.....))))))))))))..)))))..((.....))....(((....))))))))))))))..))).)))))......((((.....)))).....(((((........)))))..((((((((......................(((......)))..((.((((((((.(((..(((..((.(((......))).))........(((((((...........(((.................)))((((((((.((....)).))))))))((((......)))).....((((((((((...............(((((((((..(((((.......)))))......))))))))).............((((......)))))))))))))))))))))((((.((((((...))))))..))))((((((((((((((..(((((..(((.((........)).)))...)))))..........((((((...))))))..(((((((...)))))))...........((.(((((.......))))).))...))))))))))))))..........)))..)))..))...........(((...(((((......((((....)))).......))))).))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).))..)))).))).((((((.(((((........((((....))))........))))).))))))...............)))))))))....))))))))))..))))))))))..))))))))).)))))....))))))).))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....)))).))))))))))))))))...)))).)))))))))))).)))).)....))))))))))))..))))).))))((((((((.((((....(((((.(((....))).)))))(((((((.((.........))))))))))))).)))))))).((((((.......))))))............................((((((.(((((..........)))))))))))......((((((....))))))..((((..(((.(((...(((((.(((((((.....)))))))......((((((......)))).))................((((..(((.(((((((.((((((.....)).))))...)))))))...)))..))))((((((((.(..((((.......((((.((((.((.(((.(....))))))))))..))))))))..)))))))))....................((((((((((((((((....((((((((.(.(((.(((.((.(..(.(((((.......))))).).)))))).))).).)))))))).((.......)))))))))))))).)))))))))....)))..)))..)))).............................(((..((......))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))))......))))..)))))).)))))).)).)))))))))).))))))))).)))...)).)).))))))))).))).))))).)))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((((((((((.(((((...))))).})))....))))))))).)))(...{{,,{{{,({{{,||||||,||,..}}},......,|}|}|||..||,{{{.....,..}||.,,..}},}}}}}}.(((((((..{({.{((((.(((.(((((((((...((,{{...(((.(((((((((.((((((((((.((.((((((.((((((..((((.{.,..(((((((.((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...((((.(((((..((((((((((((..{.(.((((.((((((((((((.((((.((((((((((((((((.((((.,..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((,((..(((((.(((((((((..((((((((((..(((((..,,,(((((((,,,(((({{(((,{(({.,{,,(((({{((((((((,,.{(((((,,,.{(((((...,((..{{,(((({{((,........,,{.,{{|||,,.........((((((.......)),})))....,{..{((((((..((((((.....))))))))))))),})))}},,,}}}}.,,...,,},...,}}}))}})))))))...}},)))}}..,,},,,,,}}}}}}}},...|,{((((........)))))}}|||||||},,,,},,,..,,..........(((.....{|||,{(,.,,|||,||,|{{,.{,,..,{.(((,.....}}),))......,|{{(((({...........(((,,,....,,,.......)))((((((((,({....)).)))))))),{((......}}}}....,((((((((((.,,...,...,,,.{{(({{,||}}}}}},|,,.{{,,,||.,{{{|||||.||||||......,}},,,.,(((......)))}))))))))))))}))))||{{.((((({...}))))).,)))}{(((((((((((({..(((((..,,({{,.,......,.,}})}}.)))))..........((((((...))))))..(((((({...}))))))...........{(.(((((.......))))).))...}))))))))))))}...,,,,,{{||,..}||{{|{,,..,{|||.,||,,,,(((((,,,.,,((((,,..}}}}.......}}}}}...||||||},,}})))))}}}}))).)))}}}))))}}}}|}},,},},.,),.{(({{{,|||{{..,,,,,,|{||,.,,)))),,,,,..,))))},)))))),...,||||,,....,,,}}}}}}.,,,)))}})))))..))))))))))..))))))))).)))))..}}))))))).))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..,.)))).)))))))))))))))).,}))},.)))))))))))).)))).).,..))))))))))))..))))).))))((((((((.(({(,,,,((({(.(((,,,,|||,|||}}(((((((.((,,....,,.))))))))))))).))))}}}}.((((((.......))))))......................,,....{{{{{||||{{{.,|,||,,,.},}}}}|}}||{{,|,.{{||||,,,,)}}}})}.{|{|..||{,(((,{,{{{{{.||||||{....,)))))))....,{{{((((......))))..}................{(((..(((.(((((((.((((((.....))}})))...)))))))...)))..)))}((((((((.(..((((.......((((.((((.((.(((,{....})))))))))..))))))))..)))))))))..}}................((((((((((((((((.,{{(((({{((,{.(({.(((.{{.{,,|.{((((.,...,.))))).}.))})))}))).).)))))))).}.,},,.,.,,)))))))))))).))))))))).,,.}}}..}}}..}}}),,,,.........................{((.,|{,...,}})))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))))....}.)))),.)))))).)))))).)).)))))))))).))))))))).)))...})}),.))))))))}.))).))))}.})}))))))).)
Forensic Context

No forensic context available.