Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0085731 hsa_circPTK2_057
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141679826-141856777 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140669727-140846678 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-647.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -689.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 642.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..............((((.(((...((((..((((.(..((((......(((....)))..(((((((((....)).)))))))..((((((((.(.((((((...(((.(((...((((((((.(((....)))....(((((((.((((.......)))).)))))))(((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).)))))............((((........((..(((...((((..((((((.(..((((((..(((((((((.((..((((..((..((..(((((......)))))..))..))..))))..)).)))).)))))....((((((......(((.........))).........))))))(((((((.(((((..(((((......(((..((((..(((.....((.((((.....)))).))................(((((..........))))))))))))..))).(((((.(((((..((.......))....))))))))))...(((.(((((((....(((((((.(((((((((((.((.(((((((((((.(.............((((((........(((....((((..((((((((............(((....((.....))..)))..(((.(((((((((((((((((.......))))).)))...((((((.....(((((..((((((..((((((....((((.....))))..((((((((((.........)))).....(((((((((((((((...(((((...((((.((((((........))))))......((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..))).)))).....((((((....))))))))))..)))))..))))))))).)))))).....)))))).(((((.(((......)))..))))).......((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....))))))........(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).))))))))).....))))))..)))))...))))))....(((((....))))).))))))))).)))((((((((..((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...))))))).))........)))).)))).)).....))).)))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...)))))))))))))).)))))..)))..))))..))).....(((.(((....))).))).))))))).))).))).)))))))))))))...(((.((((((.....(((......((((((...........)))))).....))).......)))))))))))))).))))))).))))))).))).((((((((........(((((...))))).......))))))))))))))))))((((.((((((((((....))))))...))))..))))..)))))))(((((...)))))...((((...))))....(((((......))).)).))))))..).))))))..)))).)))..)).......))))..)))))))).....))).)))((((...))))(((((.((.((.....((((...(((..((((....((((((((((...)).............(((((.(......))))))............))))))))...))))..))).....))))......)).)).))))))))))).).))))))))...))))....))))).)))))))))))))((((((((((.((.......)).)))).))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,.(.(((.,,...,(((((.(.(((((((({..,((((((((((.{{(((((((,(((..((((((({{....}}.)))))))..))}......,,|||||}},}((((({({.......||}}(((.{{{{{{{{|.{{{{(((.((((,,.....)))),))))))}(((((.((((..((((((,..((..((........}}..}}.....))))))..)))).))))).....,,,,,...(((,..,{{{,(,..{{..,,||....|}}||||||,,{(({{,,,.{{{{..,.))}}.}}},})))))))))))))}}}}}}))))||||,.((((((....)))))).,,,|||||.....)}}}}}......},})))))))}))}))|,....{{{{{(({.,,{{,,{,,||{{,{({.(((({((,.{((((...,......||}||,....}}))))}.}..,,........,},.{((({..........}))},|||||,,..,,},(((((.(((((..{{......,||....))))))))))....{(,(((((((....{{(({{{.{(((|((((((.({,((({{({{{{{.|,......{{{{{{((((((........((({...{(((..{|||,{{,.,.||...{{|,{{{....((.....))..}}}..||,.(((((((((({((((((.......))))).}||,,.((((((.....(((((..((((((..{(((((.{,.((((.....))))..{{({{({(((.....,...},,,.,...{{(((((((((((((...(((((...{(((((((,((...,,...}|}|||.,,{{.((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).})).)))..})).))))..},}||||||....},)))))))}..)))))..))))))))).))))}}.....)))}}},(((((.(((......))}}.)))))}.,..,,((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......{((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))..},)))))}......,.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).))))))))).....))))))..)))))...)))))),,,,(((((....))))).)))))))))..{{((((((((.,((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...)))))),.})),......)))),,))).)).,...)))}}))))}|{{{{{....(((((((.((...((((((((((....((((....)).))|(((((.{{.((((.((........)).))))...,,.))))).,.......)))))))))).......)))))))))..((((((({{..((((........))))}},))))))))))))))}))))),.}}}..))}}..}|||.|..(((.(((....))).))),|||||}..}}}.|)),))))})))))))}...{((.{(((((.....{{{......((((((,........},)))))).....}}).......})))))))|)}}}},}}}}}||,}}}}}}},|||{((((..((........(((((...))))).....}}..))))))),)),,}}}}|||({((((((((({....})))),..{||||{{||||,,(((.(({((((,...}))))}}}}}.||,|,||}.,,,|||||,..|||,.,.}}..,,,},..}},,......|(({|,{||}||}{{...,{{{.....{{|{{|....,|{},,||.,,.|||},}}.}).}))).})}}},.,{{{{{{.,..)))))).}))))}}}}|||,..)),.,,.........(((((.(......)))))).............,}))))){{{......))))}}})))),...........}))))))}{||||.((((((((....))))),,))||{{,,{{{.{{{{{{.,,.||||||,,}||....,,,)).}}}},,))}.,},)))
Forensic Context

No forensic context available.