Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0011000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0085743 hsa_circPTK2_107 hsa-PTK2_0049
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141727697-141756959 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140717598-140746860 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-209.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -222.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 183.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((((((((..((((...((((((((((.(((......)))..)))))((((((.((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))((((......))))....(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).))))))))).....))))))((((((((((.(((.....))).))).)))))))....)))))...))))..)).)))))))))(((.(((..((.((.((((((((.((...........((((((..((..............))..))))))((((........)))))))))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...)))))))))))))).))).)).))..))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,...,(((((((.{,{|||,{{,{{(({.,{((((.(((,,....})||.))))}|,|,.{,((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).)),,....|||||.((((.((((((((.(.....).)))))))).)))),{{|,,,}{{{{{{{,,{{{{|.{|.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..,,}}}}}}.{||{{{,{{{.|||,....)))}))),,)}))||,(({{{({(,..{{((((((({.|({.((((((((,....(((((((((.((.(((...(({....}))..))).))...}))))),.})},......))))},))).)}.....)))}}))))||{{{{{....(((((((.((...((((((((({....{{{{.,,.}}.)}|{{(({,{{.((((.({....,.,.)).)}}),,,}},)})}),},......}}})))}}}}....,,,)}))))))).,((((((({{..((((........))))}},)))))))}}}})}|{,...,,,)))))}}))},,
Forensic Context

No forensic context available.