Basic Information
Symbol
hsa_PTK2_0015500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0003171
hsa_circPTK2_102
hsa-PTK2_0018
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141749117-141762415
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140739018-140752316
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-125.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-133.76 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
121.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.....((((.(((.(((((.........)))))...((((.(....)))))))).))))......)))))((((...((......((((((((.(((((.....(((....(((((.(((......)))..))))))))....((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....((..((((((.((.(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..))))))))..))........))))..).))))))))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.....((((.((({(({,.......||.,||.,..,||||.,....}}))}))).))))......)))))((({...({......((((((((.{,{{{......{{,...,|||||((({{,,{{||{{,||,|||||..{,((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).)|,,,...{{{{(.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...}}}}},,||{|..{{{{{|,||,{{{{(((({{{{{{{.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))),)))))}}}}..,.,,}})).,}}|,,..,,.}))},,,.)))))))))).,.))))
Forensic Context
No forensic context available.