Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0021200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0085751 hsa_circPTK2_080
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
8:141762002-141813749 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140751903-140803650 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-204.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -224.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 247.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((.((((.((((.....(((..((((..(((.....((.((((.....)))).))................(((((..........))))))))))))..))).(((((.(((((..((.......))....)))))))))).....(((.((((((.....))))).).)))(((((((((((((..........))))...))))))).)))))).))))..)))...)))(((((((((((((((((((.((((((....((.....))..(((.((......)).)))(((((.((((((........))))...)).)))))......(((((......))).))((((((..((..(((((..((((....(((.....)))...))))..)))))..)).))).)))....)))))))))))(((((((((((((..(((....))).(.((((((.......)))))))..(((((..(((((((((.((((((((((((((((((((..((.((.((((((((((...(((.((......)).)))))))))))))((((....)))).....((((.......))))))))..))))))..))))((((((.....((((((((((.........))))).))))).....))))))(((..((((((((........))))))))...)))......))))).)))))...((....))..)))))))))..))))).......)))))))))))))......(((....))).(((((..(((((..((.((((((((......))))))))...))..))))))))))))))))))....((........))...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((.((({.((((,,,,,(({..((((..,{{.....||,|{{,...,,)))),.,.............,..{((({..........))))}}}})))}..}}).(((((.(((((..((......,}}....)))))))))).....(((.((((((.....))))).).)))((((((((({(((,,,......}}},)}},))))))).)))))).,)))..)))...)))((((((((((((((((((((((((((....{(.....||.,(((,,(((......}))}|{{({{((.{{{,..,|||,.|||...,},||,}|,,,||,{|{{{......}}}.,.((({((..((..(((((..((((....(((.....)))...))))..)))))..)).))},})).,..)))))}}}}||(((((((((((((,{({({{,,,.,.{,((((((....,.,}|||}||,,(({{{..,{,|||{||,.,,|,|||{,{{{{||||{{..{(,{{{({{{{{||||...{{{.{{.,,.,,)),)))}))}}}}}}){(((....)))},||.,||||...,,},))}}}})),.})))}}}})}}|((((((.,(,.((((((((((.........)))))},)))).}},.)))))}|||,||||(((((........)))))}}|...}}|...,{{|||}},}||||.{{|({{,,,|..}}))})))),.))}))},))}}}))))))))))))),,.....||,,,})),.(((((..(((((..{{.((((((((,....,)))))))).,,....))))})))))})))))))....({........))...))))))
Forensic Context

No forensic context available.