ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_PTK2_0036600
Basic Information
Symbol
hsa_PTK2_0036600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0008345
hsa_circPTK2_047
hsa-PTK2_0019
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141828376-141874498
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140818277-140864399
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-106.00
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-117.42
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
126.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
..(((((((...)))))))...((((................((((((((((((.(((((.(((.((......((((((.(((....))))))))).(((((...((((....)))))))))...((((((((((.(((((((((.(((..(((((((((....)).)))))))..)))........)))))))))((((((((.......))))(((.(((((((((.(((((((.((((.......)))).)))))))(((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).............((((...(((((...((....))....)))))))))..(((...((.((((....)))).))..))))))))))))))))))))))))))))))).))).)))))))))).))))))).....(((((......(((.........))).........))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
..(((((((...}))))))...((((.....,|....,,...((((((((((((((((({.(((.((,.....{(((((.(((....))))))))}.(((((..,((({..,,))}})))))...{(((((((((.(((((((((,(((..((((((({{....}}.)))))))..)))......,.}})))))})((((((((.......)))}(((.(((((((({.(((((((.((((.......)))).)))))))(((((.((((..((((((...((..({........))..)}.....))))))..)))).))))).............((({,.{(({{(,,.{{..,,))....})))))}}}.,{(({{|,,.{(((....)))}.)}},})))))))))))))))))))))))))))))).))).})))))))))})))))))....,(((((....,.{{{.......,.}}}.........))))))))).
Forensic Context
No forensic context available.