Basic Information
Symbol
hsa_PTK2_0036800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0005982
hsa_circPTK2_024
hsa-PTK2_0017
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141828376-141900868
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140818277-140890769
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-233.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-249.56 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
257.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((..((((.......))))..))........(((((......(((((.((...((((((((..........))))))))...........(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))(((....((((.((((((((..........))))).)))))))...)))(((.((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))).......(((((.(.((((((((....((((((((((.(((((((((.(((..(((((((((....)).)))))))..)))........)))))))))((((((((.......))))(((.(((((((((.(((((((.((((.......)))).)))))))(((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).............((((...(((((...((....))....)))))))))..(((...((.((((....)))).))..))))))))))))))))))))))))))))).((((((....))))))....(((((.....).))))........)))))))))))))))).))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((..((((.......))))..))........(((((......(((((.((...((((((((..........))))))))...........(((({((((((((..(({....}}}{{.((((...{({..{||.{{{{....(.((((((......))))))})))),))..))}..)}}}.||)))))))},.|))))..((((((((({.(((....))).}))))).)))){,,.|||((((.{{((((((..,,...,,.)))))}})))))).,.}}}(({{((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((({.(((.,..((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}}}..)))){(((((((((((((...})))))},)))).))}...{,....}}...)))})))))))}.....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))).......(((((.{.(((((((({...((((((((((,((((((((({(((..((((((({{....},.)))))))..)))......,{||}}}}}})||{((((,.......||||(((.{{{{{{{{|.{{{{{{{.{(((.......)))),)))))))(((((.((((..((((((,,.{{.,{{........))..}}...,.))))))..)))).)))))......,,,,...(((,..,{{{{(,,.{{..,,}}....}}}|}}|||,,{(({{,,,.{{{{....))}}.}}},})))))))))))})})}}})))))||||,.((((((....)))))).,,,|||||,...,)}))))......}.}))))))))))))))).))))))))))..,
Forensic Context
No forensic context available.