Basic Information
Symbol
hsa_PTK2_0041200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0007786
hsa_circPTK2_023
hsa-PTK2_0004
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141840571-141900868
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140830472-140890769
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-182.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-196.97 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
265.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((..(((.((((((..((.....((((..((((.....((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).)).....))))..))))..))..)))))).)))........((((.......)))).(((((((.(.((((.((((((((((.......))).))))))).)))).).)))).)))..)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((..(({{((({((,{({.....{{{{{,|{||||,.,,{{({({((,((((((({......,,,.}}}|}|||,{{.,,,,,,.,|||}||||||||.,{({....,,||||||||,..|||,.|||,|,,,...,{,{{((((,,,,..}}}}}},}}}},)},,|||.{||{,{||||||||}},,{|,||,.((((((((({.(((....))).}))))).)))),...|||((((.,,((((((..{,...}}.))))))})))))),,.}}|(({{{(..{{((({{.,|,.{{{|{{||{{||,||||{{||.||||{,.|||{{,{((((,,((((,(((((((((....)))).))).)))}||}..})})|||(((((((((((...})))))},)))).||,...{..,,,||...}|||}}}})))},,,,,|}|||,,,,|}|}}}}}|}}}..}..}}))))).)})}}|||,,.,||||,,.,},)))},}}.,{||||||||||||||||||||||||}}||||||||}}..,,.,)))}}))}}))),..}}}}|||}}},,.,}}||{{{........||||,{{.{{{{,|.{||||{{{{{,{{{|,..,,,,))))}))}))),))},.,,)))),}))..)))))))..
Forensic Context
No forensic context available.