Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0040500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0135926 hsa_circPTK2_007 hsa-PTK2_0153
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141840571-141935848 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140830472-140925749 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-212.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -227.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 211.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((((((((((((((...........((((.((((((..((((((.....(((...........))).))).)))..)).)))).....((((.((.((.........)))).))))...((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).))......)))).....))))))))))))))))........((((.......))))(((....))).((((.((((((((((.......))).))))))).)))))))))..)))).))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((,(({{((((((((((((((((..,..,,{{..{,(({(((({{,,((({{{.,,,.,,|,,..,,,...,))),))},))),.)).}|||,,,{{(((.,{,{|{{......{{{|.{{{|,,...((.({{((({(((({{{,,,....{{{....{,((({{{.{{,,,,..||,}}}||||||.}||,......|{({(({|,..,|{,.|,,,{,,,...,{,{(((((......))))))}}})),)}.}}}}..},||{||}|||,|,,..||||},.((((((((({.(((....))).}))))).)))}{{{.,,,((((.{{((((((..,,...,,.))))))}))))))...}))(({{((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}})..)))){(((((((((((((...})))))},)))).))}...{,....,,...)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))).......{{{,....)}))))})},,,))},))))),..,})},,},)})))))),.))).}}.....,))),.,,,.))))))))))))))))....}}.}|||,.......|}},.{{.,{,|,|.{(((,((((({((((.......)))},)))))).)))}})})),,}))).))))))....
Forensic Context

No forensic context available.