Forensic RNA Knowledge Base

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.

Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.

Minimum free energy

-159.10 kcal/mol

Thermodynamic ensemble

Free Energy: -172.45 kcal/mol

Frequency: 0.0000

Diversity: 223.98

MFE Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((..((......))..)))))).............(((((((...((((((((((((((((.......)))))))))..((((((..........))))))........(((........)))..((((((.(((...((((((.((((...)))))))))).)))..)))))).....(((((((((..........((((((..((((......))))))))))..(((((.((((.(((.(((((....(((((((((((........))))).)))))).....))))).))).((((((((((((((.........)))))))))))).))..((((((((((.((..(........)..)))))))...))))).)))).))))).....((((((((.........))))))))(.(((((.(((((.((...(((((.(((((........)))))..)))))..(((.....)))((((((....((((.(((((....))))).))))....))))))))))))).))))).))))))))))..)))))))...)))))))(((((((((..(((.............))))))).))))).))))((...))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((({((((({.((....,.}}|,|)))}}....,........(({((((,,.(((((..(((((((((,....,}}))))))))..|||||,..,..,,,{,},))}}.......,,.|||,,,||{{(({({.{{{{(({,,..,{{(({,{{{(,..|}},,}}}||,{{{,,,,{{{{{({(((({,,,.,,,{,|,,,.,|(,(((({.(((({.....},))))),))))},}}|......,,}))),}})}))}}.)))))}.,,..{{(((((((.....))))))))),,}}|},|.((((((((((((((.........)))))))))))).)},|{{{{{(((((.((..(........)..)))))))...)))))}}}))}}}},.}}}}}((((((((.........))))))))|,|||||,||{|}|{{{{{((({(.(((((,,......))))).,|}}}}..{{|.....||}{{{(({.,{,((((.(((({....}}))).))))....)))))),))})))}))||},,||,,|||||,,|||}}}}...}}))})}{((((((((..(((.............))))))))))))).))))((...))

Basic Information

Secondary Structure

Structure Prediction

Forensic Context