Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0002900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0100
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141684397-141716304 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140674298-140706205 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-173.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -185.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 121.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((((.....((((..((((((..(((..(((((((.......(((((((((...((((....))))..........((((((((((.((((((((((.....))))..((((((..(((((...(.(((.((((..((..(((((((((..((........(((((...))))).....))..))))))).))....(.((((.((((((((((....))))))...))))..)))).)(((.((((.(((...)))))))))).(((......)))(((((......))).)).....))..))))))).).)))))..))))))...........((((((((((...(((..(((.(((((((.....)).))).)).)))...))).))))))))))))))))..).))))))))).............).)))))))).....)))))))...)))..............))))))..))))....)))))))..)))))...(((((..(((.((((((....))))))..)))....)))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..(((((((...{{((((..((((((..(((..(((((((.......(((((((((...((((,...,}}}.....,,,||(((((((((..{(((((((((.....))}}|.((((((..(((((..,(.(((.((((..((,{(((((((((..((........(((((...)))))...,.))..))))))).))....{.((((.((((((((((....))))))..,))))..)))).}(((.(({(((({...}))))))))).,||},}}}}}}}||{((,..,||},}.}}....,))..)))),},.}.)))))..))))))........,{,{{{{{{||||...{({,.{{{|{{{(({{,,,,,},.}}}.}}.}))}},|||.|}}}})))))))))))|,,.,}))))))).............),}))))))).....)))))))...)))..............))))))..))))}...)))))))..)))))...{((((.,({(,((((((....}))))}..)))....,)))).),.,,,,
Forensic Context

No forensic context available.