Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0004000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0511
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141685529-141753429 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140675430-140743330 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-290.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -306.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 220.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(.....).)))))))(....(((.....(((((......)))))(((((((((..(((.((((......((((((...(((.....)))....)))))).......(((((((.......(((....)))((((((.((((..((((((.(((((.((((((((((.(((.(...((((.(((((((((((.((((((.....(((..((.(((.(((..((.((.((((((((.((...........((((((..((..............))..))))))((((........)))))))))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...)))))))))))))).))).)).))..)))))).)).)))..(((.(((....))).))).(((((((......))))))).......)))))))))))).......))))).))))...).))).))))))....((((((.....))))))((((((..(((((...(.(((.((((..((..(((((((((..((........(((((...))))).....))..))))))).))....(.((((.((((((((((....))))))...))))..)))).)(((.((((.(((...)))))))))).(((......)))(((((......))).)).....))..))))))).).)))))..))))))......)))).))))).)).))))..))))....))))))....))))))).......)))).))).)))))))))...((((((((((...)).............(((((.(......))))))............)))))))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.(.....).)))))))(....(((.,...(((((......}}}}}(({((((((,{{({,((({......((((((...(({.....)))....)))))).,{,...,,,,|||.......|||||,.)))||||||.{(((..((((((.(((((.((((((((((.(((.{...((((.(((((((((((.((((((.,...(((..((.(((.(((..((,(({(((({(({,((...,{{....,||,{||,.||...,},,,,..,|,},..}}})))||,|,,.,,...,}}}}}}}}}}(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)){(((((.{{.((((.((........)).))))...,,.))))).,.......)))))))))).......)))))))))..((((((({{..((((........))))}},)))))))))))))).})).}}.))..)))))).)).)))..(((.(((....))).))).{((((((......))))))).,,....)))))))))))).......))))).))))...}.))).))))))....((((((.....)))))}((((((..(((((..,(.(((.((((..((,,(((((((((..((........(((((...)))))...,.))..))))))).))....{.((((.((((((((((....))))))..,))))..)))).}(((.(({(((({...}))))))))).,||},}}}}}}}||{((,..|||},}.}}....,))..)))),},.}.)))))..))))))......)))).))))).)).))))..)))}..,,||}}}},,,,})}))}}.,}..,.)))),}}}.))))))))).||{((({{{{||,..))..........,,.(((((.(......))))))............,})))))))))....)
Forensic Context

No forensic context available.