Basic Information

Symbol
hsa_chr8_0162500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0354
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
8:141738207-141738811 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140728108-140728712 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-220.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -229.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 90.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((((.(.(((((((((.(((((((((((((.((.((.((.(((((.((((.(((((((.(.((((((.(((((((((.((((((((...........((((((................(((((((.....))))))).((((((((.(.(((((((....(((((...((......))...))))).....((((.((....(((((((((((((((((((.((.(((........))).)).))))))))...........)))))))))))...))))))......((((....))))..((((((....)))))).)))).))).).))))))))..)))))).......(((..((((...))))..)))..((((.....))))(((((.............)))))...)))))))).)))))))))..)))))).).))))))).)))).))))).)).)))).))))))))))))).))))))))).).)))).))))))))((((((((.((.....(((((((((((.......(((....)))......))))))))))).............)).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.((((.(.(((((((((.(((((((((((((.(,{((.((.(((((.((((.(((((((.(.((((((.(((((((((.((((((({..,........((((((................(((((((,....))))))).((((((((,(,(((((((....(((((...({......}}...))))).....{(((.((....(((((((((((((((((((.((.(((........))).)).))))))))...........)))))))))))...)))))}..,,,{{{{,.{{{||,,...||||},,,,}}}))}.}}}}.}}).}.}}))))))..)))))}.......{{{..((((...}))),,))}..{{{||,,}.}}}}{{||||,,.....,,},.}}}}))}.)))))))).))))))))).}}))))).).))))))).)))).))))).)).)))).))))))))))))).))))))))).).)))).))))))))((((((((.((,....(((((((((((.......(((....)))......)))))))))))....,........)).))))))))
Forensic Context

No forensic context available.