Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0013300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0099
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141745350-141772487 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140735251-140762388 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-213.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -228.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 181.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((((((.((....(((((..((((....(((.....)))...))))..)))))...)).))))((((.(((.((((((((((...(((((((((((..........((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..))).)))).....((((((....))))))......)))))....((((((((((((..((((...((((((((((.(((......)))..)))))((((((.((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))((((......))))....(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).))))))))).....))))))((((((((((.(((.....))).))).)))))))....)))))...))))..)).))))))))))))))))...(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...))))))).))((........)).....)))))))))).))).)).)).......((((...........((((((........))))))))))...)))))))).((((.((........)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.(((,{{{.{{....(((((..((((....(((.....))}...))))..)))))...}|,||},((((.(((.((((((((((...{{,{{{(((((.(({,,{{,.((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..})).)))).,,.{((((((....}))))}},.}..}}}}}....((((((((((((..((((...((((({((((.{{(..,...})}|.))))},.,..,,((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).)),,....{|||{.((((.((((((((.(.....).)))))))).)))).,.}}}}},,||.,....||||,||,(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..||||,,}||{((((({{((.{{{.....))),))),)))))))}))})))})...))))..)).)))))))))){|||,...,||(((((({.((.(({...{({....)))..))).))...)))))},.||,,......,,)),.,,,)))))))))).))).)).}),..,,},(((,..........{((((((........)))))))}}),..)))))))).((((.((........)).))))
Forensic Context

No forensic context available.