Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0016700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0540
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141749117-141780898 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140739018-140770799 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-488.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -525.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 506.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.....(((((((.....)))..((((((.....))))))(((..((((((((((....(((((((....(((((..(((....(((((((.((..(((((((((((..........)))))......(((((.((.((((((((((..(((((...((.((...(((((((..(((((((............))).))))..))))))).)).))..))))).....))).))))))).))((((........))))..(((.((((((.......)))))).))).((((((((((...(((((((((............))).))))))))))))))))..)))))........)))))).)).)))))))...)))..)))))...((((((.......))))))))))))).((((((.......(((........)))..((((((((.(((((......((((((.((((((.((((((.....)))))))))))).))))))(((((....))))).((((....)))).)))))..)))))))))))))).....(((((((...)))))))....(((((..((.(((((.((((((...........((..(((((..........(((.(((....))).)))((((.(((...))).))))......)))))..))(((..((((((...))))))..))).((((((((.........((.((((((((((......(((((..(((((((.((((.(((((((((((((......((((((((.....))))))))..((((..((((((((((((((....)))))))...(((((((.((((....................((..(((((.(((((.........(((.(((((.(((((.............))))).)))))..)))(((((.((.....)).)))))))))).)))))..))..((((((((...........(((((((((....((((.((.(((..(((.((((.....))))..)))..))).))))))..(((..............))).....)))))))))........)))))))).................)))))))))))...............(((.(((((((....((((((((((.(((....)).).)))))).))))..))))))))))...)))))))..))))..)).))))))..))))).))))..........)))))))..)))))........)))).)))))))))))))))).(((.....))).))))))...))))).))..))))).))))))))))...)))(((....)))..))))......))).))((((..(((((....(.(((((((....((((((.........(((((((((((.((((..((((((....)))))).(((....)))....(((.((((...)))))))..((((...)))).)))).)))))))....))))......((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....((..((((((.((.(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..))))))))..))))))))...))))).)).)....))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((.((((.,{{,.....},,.(((((((.....))))))),,((((((((((((.{{{,,,((((((({(((((..(((....(((((((.,,..(((((((((((..........))))).....,(((({,({.((((((((((..(((((...((.,{...(((((((..(((({({.{{,.......,))},))))..))))))).}),)}..)))))....}))}.)))))))|||((({........}}}}.,{{{,{{{(((.....,,)}|))}.}},.((((((((((...(((((((((............))).)))))))))))))))).,}}}}}}}},.,..}))))).}}.)))))))...)))..)))))...}.))))))}....,.{(((((,.{{,,{{..,.}}}.},,.)))))}..,.,,}.})})))}.)))))))).),..((((((.((((((.((((((.....)))))))))))).))))))(((((.,..}}}}).((((....)))).,{{{{{{....})))}}},..,},..{((((({...})))})),...)))).})}.)))(((((.(((((............,((((((..........(((.(((....))).))}((((.(((...))).))))(((((...(((((({((({,(((((,.,{|}||||.,||,.{((,,{{,,{,,.,{(({{.{(((({((((,....,(((((..(((((({...,,,,,,,,.{{{{,.....({.((((((((.....)))))))).)),,...,,.{{.((((((((....)))))))}.||((({((,.{{{|,|{{{.{{{{{{({{{{,(((({(((((.(((({.........(((.(((((.(((({...........,.))))).)))))..))){((((.((.....)).)))))})))).))},,..,...|||{,,{{,{{{,{,,,{{{{((((,,...|||.,,.....|||,,,{,|||,|,.,|||||||,,.,,{|||||||}}|.,}},.........,,,,|||,.,,|},.........}}}}})).)))),}}}),}},.,}}}}..((((((.{.{,{((((((((......(((((((((((((....((((((((((.,((....)).,.)))))).))))..))))))))....))))).).....,..))))},)))),.).))))))........,,,,|}}}}}}..}}))),},,....)}}}}})))))))})).,,})))}},,,)}}.,))))}))..,||||||{{{{{(({{..,|||{{,,.,{{{{{{{,{{...||..,}}}},....}},||((,(((....{{{,|||,|{{{{|},,..,,,}}}.}}}.,},.|||,.|,,.}))),}},}}|||||,,..,.)))))),,,,))))}..)))))})))}))}}}}}}}..}}}})))))))))))))...)))))...))))))}..,.((.((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..)))))))).))......(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))..,|((..((((((.{{.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..},))))))..))},,.{((.{{{.....))).))}))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.