Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0028200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0214
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
8:141798263-141856777 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140788164-140846678 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-543.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -585.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 502.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.