Basic Information
Symbol
hsa_PTK2_0030200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0452
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141799573-141931022
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140789474-140920923
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-361.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-390.42 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
405.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((((((((((((((...(((((..((.((((((((((.......)))).))).)))..............(((((((((((...((((((((.((((.((........(((((((..(((.((((((..((.....((((..((((.....((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).)).....))))..))))..))..)))))).)))........((((.......)))).(((((((.(.((((.((((((((((.......))).))))))).)))).).)))).)))..))))))))).)))).))))).((..(((((((((............((....((((((..(((....)))....(((((((((.......(((((((..(((....)))))).))))........)))))))))((((......))))((((..((((((....)))))).))))))))))))............)).)))))))..))...)))...))))))).))))......((((.((..(((((((..(((((..........))))).....)))))))...)).).)))...))..)))))...)))...))))))..))))))))).)((...((((.((((((....((((...((.((((.........(((.((((((.....))))).).)))(((((((((((((..........))))...))))))).))..........((((....(((...))).....))))...((((.....)))).....))))))...).))).....)))))).))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((((((((((((((((...(((((..((.{(((((((((.......)))).))).))}....,,,.....,.(((((((((((.,.((((((((.((((.((........(((((((..(({{((({((,{({.....{{{{{,|{||||,.,,{{({({((,(((((({{......,,,.}}}|}|||,{{.,,,,,,.,|||}||||||||.,{({....,,||||||||,..|||,.|||,|,,,...,{,{{((((,,,,..}}}}}},}}}},)},,|||.{||{,{||||||||}},,{|,||,.((((((((({.(((....))).}))))).)))),..,|||((((.,,((((((..{,...}}.))))))})))))),,.}}|(({{{(..{{((({{.,|,.{{{||{||{{||,||||{{||.||||{,.|||{{,{((((,,((((,(((((((((....)))).))).)))}||}..})})|||(((((((((((...})))))},)))).||,...{..,,,||...}|||}}}})))},,,,,|}|||,,,,|}|}}}}}|}}}..}..}}))))).)})}||||,,.,||||,,.,},)))},}}.,|||||||||||||||||||||||||}}||||||||}}..,,.,)))}}))}}))),..}}}}|||}}},,.,}}||{{{........||||,{{.{{{{,|.{||||{{{{{,{{{|,..,,,,))))}))})))}))}},,,)))),}))..))))))))).)))).))))).{{..(((((((((............{,....(((((,..(({....}}},,,.,{((({|{(,,,,{({(((({((..((({...,||||}}}))}.}|,,},,))))}},})|{{|..,,,,)))|((((..((((((....)))))).))))))))))||.,....,,.,..)),}))))))..}}...))).,.)))))))},))),.....||{{.{({.(((((((..{((((..........))))}.....))))))).},,),,.,,....))..)))))...)),..,)))))}.,))))))))).)((...((((.((((((....((((...((.((((...{....((((((((....,.((({{{{{..(((,(((((((({(((..,......})}})}}})))))))(((({.....,.})))...}.)))..}})))))..,......))))))))....}.....))))))...).))).....)))))).))))...))
Forensic Context
No forensic context available.