Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0043000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0545
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
8:141856359-141857399 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140846260-140847300 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-147.57 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -164.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 171.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((.....((.((((((((((.......((((.(((.((((.((....((((((..........))))))((((((((...((((.((((((...........))).))).))))..)))).)))).......(((((((....))))))).........(((((...(((((.........)))))...))))))).)))).))).((((((...........)))))).......(((((((((...((.(((((...((((((((...((((((.....))).)))...))))))))..............(((((((((((...(((.((((((((........((.((........))))....))))))))....)))...))))))))))).................((((.(((((((....((((......(((((...)))))....)))).((.((...((((((((..((((((((((((....(((..(((((.(((.............((((((((......(((((((..(((((...............................))))).)))))))......))))))))))).)))))...))).....))))))))))))...))).)))))..))..))...))).)))).))))(((((((((....)).)))))))....))))).))..)))))))))...))))......)))))))))).)).....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,,..,{.....{(.((((((((((.......||||.(((.((((.(,....((((((,{.....,,.))))))((((((((...((((.((((((...........))),,)).))))..)))).)))).....,,(((((((....)))))))..,,....,(((((...(((((.........)))))...))))))).)))).))).((((((.,,.....,..))))))..,,,..(((((((((...((.(((({...((((((((.,.((((((.....))),}))...))))))))..,{{{{{{{..,{(((((({(((({,,....{{{{{(({,.......{,.((........}},,....}}))}}}}}}}}}}}}}})}}.}}}}}}},............,.,,|{{{.(((((({....((((......(((({...})))),...)))).,,.((...(((((,{(,,((((((((((((...,(((..(((((.{((....,.......,{{((((((......(((((((,,{{{((||.,...,,.....,,,,.........,,..}}))),)}}}}))}}....)))))))}))).)))))...))).,,..))))))))))))...))}.)))))..)).,)}...}))}}})),||,,((((((({{....}}.)))))))..,,))))).))..))))))))).,.))),......)))))))))).)),,.,})).
Forensic Context

No forensic context available.