Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0043200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0513
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141856359-141900858 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140846260-140890759 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-163.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -177.10 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.((((((..((.....((((..((((.....((.(((((((((((.((.((....((......((((......)))).(((((((((((((..(((....)))((.((((...(((..(.(.((((....(.((((((......))))))))))).))..)))..)))).))))))))))..)))))..((((((((((.(((....))).)))))).))))....(((((((...((((((..........)))))))))))))((..((((((((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))).(((((...((((....)))))))))..))))))).))....))..)).))))))))..))).)).....))))..))))..))..)))))).)))........((((.......)))).(((........))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((.((((((..((.....{(((..((((..,..((.(((((((((((,({.,.....(({..,.{.((((((.{{.,,,..}}.)))}}),),.}||,......{(({(((,{,.,|{,.{,,,{,,,...,{,{{((((,,,,,.}}}}}},}}))})),}||,.{|,{,{|||{{|{|,,,,{|,|||.((((((((({.(((....))).}))))).)))}{,,.,{{((((.{{((((((..,,...,,.))))))}))))))...}}}(({{((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((({.(((,,,,((((..((((.(((((((((....)))).))).))))}}}..))))|(((((((((((((...})))))},)))).))}...{....,||...)))})))))))}....,}))))....))))))))))))..)..))))))).)}))}.,,...,{{{,..,,},}))},))...)),})))))}...,}..)).))))))))..))).))..}..))))..)))),.))..)))))),))},,..,,.,{,,........||||{{{,...,)},,)}),
Forensic Context

No forensic context available.