Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0045400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0136
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
8:141871323-141900868 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140861224-140890769 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-170.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -182.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 213.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((..((((.......))))..)).......(((((..((....(((((.(((.((((((((..........))))))))((((..((((....))))..))))..((((.((((..((((.(((((((((((((........(.((((((......))))))).(((.((.(((.........))))).)))((((.....((((((((((.(((....))).)))))).))))...))))(((((..(((.((.((((..((.....)).)))).))))))))))(((.(((..(((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))).))).))).))))))))))))))))).(((.((((..(((.........)))..)))).)))....))))))))))).))))).....)).)))))((((....))))(((((....)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{{..{{,,..,,{({|.||.,{,.......|||||.}||}...,,{{,.((({((((((((..........})))}|||......||||...,||||{(((((.(((({.,((((,((((((.....((((((((.......{.((((((......}))})),||||,||,{((,.,{,,.{||||||,|}}|.{{{,{{.((((((((({.(((....))).}))))).}}}},...|||((((.{,((((((..{,...||.)))))}}))))}}{{.,,|{{({,{,{....||}.}}}}||||||}}|}}})}}}|||||.|||||,.||}}},|{|||,.|,||.,}||||.,,....))))))))...)))))}.))}}{(((((((((((((...})))))},)))).)))...}},.})))).))))))...,,(((((.,|..{|....})..}})))))........{{{.((((((.{((((.{(..((((((((.((..((((((((............})))))))..)}.))....)))))).)))))))..)))))).)||,{....})))}|}})))}}.,,.},.
Forensic Context

No forensic context available.