ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_PTK2_0047700
Basic Information
Symbol
hsa_PTK2_0047700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0233
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:141879241-141879774
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140869142-140869675
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-132.60
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-142.35
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
96.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(.(((((..........................((((((.(((((((((((((....((((....))))..))))(((((((......))))))).((...(((.......)))....)).((((((((...((((((((.((((....(((((((.....((((...........(((((.(((((..((((((((....)).)))))).))))).)))))....)))).)))))))....(((.....)))......(((((((((...(((((((...(((((....)))))...))))))).))))))))))))).))))))))....))))))))))).)))))).))))))(.((((((((..((((((.......)))))).)))))))).)..((((.(((((......))))).)))).(((.(........).)))........)))))..)(((((((((((.((((.(((...((((.(((...........))).).))).))).)))).)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
(.(((((..........................((((((.((((((((({(((....((((....))))..|}|,(((((((......))))))}.{{,..{{{.,,....)))..,.}}.((((((((...((((((((.((((....(((((((.....((((...........(((({.(((((..((((((((....)).)))))).))))).)))))..,.)))).)))))))....{,{.....,}}......{((((((((...(((((((...(((((....)))))...))))))).))))))))))))).))))))))....))))))))))}.)))))}.)))))}{.((((((({,.(((({,,,.....)))))}.)))))))).}..((((.(((((,....,))))).)))).(((.(........).))).,......)))))..)(((((((((((.((((.(({{,.((({.{{,...........}}}.),))),))).)))}.)))))))))))
Forensic Context
No forensic context available.