Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0048300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0235
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:141887526-141888374 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140877427-140878275 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-193.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -214.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 177.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((......((((((((((((((.(((((....(((((.......)))))))))).......))))))))))))))((((((((....)))))))).(((.((((......))))...)))....(((((((.(((((((((.((((.((((((((((.(............(.((((((((.((....)))))))))).)).))))))..)))).)))).))).))))))((((.....(((((((((((.(((((((((((.((((.......)))).))..)))...((((((((((((.((((((..(((((..((((....)))).....))))).))))))))))).)))))))...((((((.(((......))).)))))).....(((((......)))))....((.(((((((..(((.((((((((((((......)))))))..))))).)))..........(((..((((.....)))))))))))))).))..((((((.((((((((...................))))))))))))))...(((((....((((((.......................(((((.(((((((((((((.........)))))))))..(((((.(((.......))).))))).((((.......))))..................)))))))))....))))))...))))).)))))).)))))))..)))).......))))..........)))))))....((((.((((((.....)))))))))))))))))..)))))...(((((((......))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((......{(((((((((((((...{({...,(((((.......))))),)...,,,....)))))))))))))},(((((((....)))))))}.,,{.((((......))))...,,..,,}||{{{{,.(((((((((.((((.((((((((((,({,,.........,.{{{((({,,((,...)))))))))),)).))))))}}}})).)))).))).))))))((((.....(((((((((((.{((((((({((.((((.,.....)))).))..|||...((((((((((((.((((((..(((((.,((({....}))).....))))).))))))))))).))))))).,,|{((((,(((,,....|||,}}}}||{{,..{{{{{.,..,,}))}}...,,.,|||..,...|||.{{{{{{((((({......))))))}..))))).))),},,,,,,.}|||..||||......{|||....)))),,....(((({((((((((((....,,.....,.......))))))))))))))...(((((....((((((.......((((..........}},},||,||.,(((((((((.........)))))))))..(((((.(((,....}.))).))))},{(({,,,,,..,,,,.}}}......,,,,|...,,..,.}}},,..))))))...))))).)))))}.)))))))..)))).......))))..........,,}}}}}....{(((.((((((.....)))))))))})))))))..)))))...(((((((......))).))))
Forensic Context

No forensic context available.