Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0048800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0475
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141889570-141931231 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140879471-140921132 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-208.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -224.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 288.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((...........)))))))((((.(((((....((((((((...(.(((((......(((((....)))))...))))).)....)))).))))...((((((((((((((...((....(((((((.(((..................))))))))))....))..))))))))))....)))).((((..((((((((....((((((....(((((((...(..((((((....)).))))..))))))))....)))))))))))))).)))).......((((((.((((((((((((((...................))))))).....(((((((((((.((......(((((.......(((((..(((..(((((....(.((((((.((......)).)))))).)...(((......))))))))...)))..)))))....))))))).))))))))))).((((..(((((((((...(..((((.((((.......((((.((((((((((.(((....))).)))))).))))(((....((((.((((((((..........))))).)))))))...))).)))).......))).).))))..).)))))))))))))))).)))).)))))))))))))))(((((.(((.........))).)))))(((((....).))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,({(((,({(.{{{{{{..||||,,,,.,.}|||,,.}}}||||.|||,|||.||,...,,...(((((....)))))...,,|||,|,{{{|||{.|......{{{{((((((((((...((...,(((((({{(((,.....,,......,.,})))))))))}....))..))))))))))....)))),||||}}{{{{,,,{|{{{(((((((,(.,,(((((...,,,((((((....))))}))...))||||{.||{|||,|||,||||||.,,|}{{{{...}}||.}}}}}|{{((((((((.,.................)))))))},,.,|,..,,,}}}}}},}))}}..,,,,....}}}||,,,.,|,},}},||,.,}}|,{(({{{,.,||||..|||}}}||||}|,,{||...,||||||||||...||||||||||.,,...,|,{{((((,,,,,.))}}}}}||||,||,{{{,.,|,,|{|||||||}}},.|||||{.((((((((({.(((....))).}))))).}))},,..,{{((((.,,((((((..{,...|}.}))))}})))))},,.,}||||{|,{,,,..}||.}||}||,|}|}}}})}))})))}})|})))}.,}}))))}}))))}}{|||{}{{{,,,,....}))),))),}|||||,,.,)})))}..
Forensic Context

No forensic context available.