Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0049700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0464
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Intron
Location (GRCh37)
8:141889570-141994283 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140879471-140984184 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-278.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -294.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 284.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..............(((((((((((.(((...))).))))..((((.((((((((((((.(((..((((((((.....(((....((((((((.........)))))...)))...))).(((((.....(((((......)))))....)))))))))))))..)))))))))....................((((((.......))))))))).))).))))...(((.((((((((.(((((((((((...(((.((((....)))).)))...)))))))..((((((...((.(.((((((..(((.((((.(((((((...(((((....(((((((.((((....)))).))))))).(((((((.((((((.......))))))(((((((((......))))))..))).(((((.((((((((((((.........(((((((((((((((..((((((.....(((...........))).))).)))..)).)))).....((((.((.((.........)))).)))).............((((((((..........))))))))..............)))))))))..))))).........))))))).)))))...........))))))).........)))))..))))))))))).)))))))))).))....))))))............)))).))))))))..))).)))))))(((((((...((((((..........))))))))))))))))((((((.....((..(((.(((..(((.(((((((((..(((((((((((.((....)).)))).)))))))....)))..)))))).))))))...)))..))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((........,,,,,{.,,,,||||||,(((...||}.}}}}.,((((.(({{(,{(((((.(((..((((((((.....(((,{{.{((({{{{..{,.....))))}...}}}.,,))).{((({..,,,(((((......}))))....})))}))))))))..))))))))),..............,,,.(((((((.......)))))))(((((((.{((....((.(.((((....)))).}.}}...)}},)}})))){(((({....}})))).,,,,,((({((,..{(.(.((({({..{((,|{((.((((({{...(((((..,,{{((((({((,..,}}))))}}}}}}}}.{{{{((({,((((((........,,,))))}|||||.....,))))).,||}},(((((.(((((((,,{{,{{,.,....{((((((({((((((..((((((.....{{{...........))).))).)))..)).)))}.....((((.((.{(,......,}}})).)))).....,,......((((((((..........))))))))....,,......,,))))))))),,)},}),....,,,.))))))).))))).,,,.......|}|||||{....,.}})))))..)))))))))}}.)}}})))))}.}}....)))))).||{,((((({.(((....))).)))))).,)))}},,|{{((((.,.((((((..,,...,,.))))))))))))))))(((((({{,..((,,,((.(((,,({(.{{{{{|{||,,||{||{||||{.,,,,,,,,,|||}.||||}||,,,,|||..}})))).))),)))}.}}}.})))}))))
Forensic Context

No forensic context available.