Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0051400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0459
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:141921129-141922216 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140911030-140912117 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-321.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -342.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 246.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))(((.((.(((((((((((((....(((((..(((((.(((((((((((..(((((.(((.((((((.(((((((.((((((((((((.((.((((..(((((.((((((((((.(((((((((((((.(.(((((((((.((((((((.(((((((((((.((((.(((((((((((...((((((((((....)))).))))))..)))))))..(((((((.(((((.((((((((..(((((((((.((((.....(((((.(((.(((((.(((...(((.((((((.(((((((.......)))))))((((((..((......(((.((((((((((((.(((((((((.((((.....)))).))))).))))...((((.((.(((.......))).)).))))...((((..(((((((..(((....(((((......)))))))))))))))..))))((((((.((.((((..(((((.(((........((((((((....)))))))).......(((((...(((.......)))...)))))(((((..........))))).......)))...)))))..)))).)).))))))..(.(((((.....(((((........))))).....))))).)....)))))))))))).)))))..))))))..)))))).)))))).)))))..))).)))))(((((.........))))).....))))...)))))))))..))))).)))))))).))....)))))...((((.((.((((((((((.....))))).))))).)).))))..((((.((..(((((.........)))))..)).))))....((((..........))))................)))).)))))).))))))))).)))))))).))))))))).).))))))))))))).)))))))))).)))))..))))))..)))))))))))).))))))).)))))).))).)))))..)))))))))))))))))))))....)))).....))))))))).)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....))(((.((.(((((((((((((....((((...(((((.(((((((((((..(((((.(((.((((((.(((((((.((((((((((((.(.(((((..(((((.((((((((((.(((((((((((((.(.(((((((((.((((((((.(((((((((((.((((.{{{,(((((((.{,((((((((((....)))).))))))}.)))))))....,{{{({(((,...,,(((((((,,((((((({{{.((({{.(((((,(((.(((((.(({..{(((.((((((.(((((((.......)))))))((((((..,{{{{,..(((.((((((((((((.,{{{(((((.((((.....)))).}))}}||}}}...((((.((.(((,......))).)).))))...((((..(((((((..(((....(((((......)))))))})))))))..)))){(((((.((.((((..(((((.{{{,,,.{{{{(((((({,...,))})))))}},},..,{{||.,,{{|,,...,,})}}}}||||{(((,,...}}}}))}),})),,,....}})...)))))..)))).)).)))))}..{.(((((.....(((((........))))).....))))).,....)))))))))))).)))})}}))))))..)))))).)))),}.}}})),,|||.}}|}}(((((.,......,||||,...,...}}}||,...}})))}...}||||||.,.{{{.,.{{((.......}}}}.,.}||{{((({((.....}}}}}},}})}.))}))}..,{{{,.....||||},},,.,,..,,}))}})).,,,,..})))).,},}}}}},.,)))))}}....))).},.,}))}.)))))).))))))))).)))))))).))))))))).).))))))))))))).)))))))))).)))))..)))))}..)))))))))))).))))))).)))))).))).)))))..)))))))))))))))),.,})}},.....}))}.))))))))).)).)))
Forensic Context

No forensic context available.