ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_PTK2_0051900
Basic Information
Symbol
hsa_PTK2_0051900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0263
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:141934024-141934449
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140923925-140924350
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-124.80
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-131.68
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
89.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(((....)))(.((........((..(((((((........((((((((.(.(((...))).).))))))))......)))))))..))..((.(((((((....))))))).))................(((.((((.....))))..))).....((((((.......))))))(((..(((..(.((((((.(....))))))).).))).....))).((((((((.(((((((((..(....)..))))))))........).))))))))((((((((((((((((.(((......))).)))))).))))..((((..........((((((.......))))))...))))..........))))))((((((.(((...))).)))))).((((((((....))))))))..)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
(({....|||(,(,........{{..{((((((....{...((((((((.(.(({...}}).).))))))))......)))))))..}}..((.(((((({....})))))).)).............,..(((.((((.....))))..))).....((((((.......)))))).||..{{{..{.((((((.(....))))))).}.})).....))).((((((({.(((((((((..(....)..)))))))),,,.....,.}))))))){{((({((((((((((.{((......))}.)))))).))))..{({,....,,||..|,||{{.,,....}}}}}}..,|},,.,.......,))))))((((((.(({...})).)))))).((((((((....))))))))..,,.}
Forensic Context
No forensic context available.