Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0054500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTK2_0254
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:141991596-141992343 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140981497-140982244 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-202.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -217.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 158.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((.((((((...)))))).(((((((..(((((.......((((((((........((((((((...((((...(((((((((((..((...))...))))...))))))).......))))...)))))).)).((((((..(((((.(((.....................))).))))))))))).(((((((....((((((((((((.......))))))..(((((.((((...)))).)))))...((((((.(((((........)))))........(((((((((...)))))))))))))))....)))))))))))))))))))))....)))))....))))))).)))))).))).....((.((((.(((((......))))))))))).(((((.....))))))(((((((((((((......(((((.((((((((..(((((....)))))..(((.(((((((((((((......))))))).....))))))...)))......((((((((..((((((((.......)))))))).((((.......)))).......(((((.....)))))(((((((....(((.....))).....)))))))..........))))))))..((((.(((........))).))))....)))))))))))))...)))))))))((((.....))))((....))...........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.((((((.((((((...)))))).(((((((.,(((((...,...((((((((........{{((((((,{,((((,.,(({(({{{(((..{{...}}...)}})}.,}))))))..}},..}}}}.,})))))).},.{(((((..(((((.(((.....................))).))))))))))}.(((((({...,((((((,{{(((.,,,,,{|,}},,..{{{{{|||||,,.,))}.)}}}}...((((((.(((((........)))))........(((((((((...))))))))))))))).,..)))))))))))))))))))))....))))).,..))))))).)))))).))},|,..{{.((((.(((((......))))))))),}.(((((.....)))))}{{(((((((((((....,,(((({,((((((((..((((,,,,,}|}},.,{({.(((((((((((((......))))))).....))))))...)}}......((((((({..((((((((.......)))))))).((((.......}))).......(((((.....)))))(((((((....(((.....))).....)))))))..........})))))))..{{((.({{....,,..))),))}),,,.))))))))))))).,})))))))))|{{{.....}}||{{....,,....,..,}},))})
Forensic Context

No forensic context available.