Basic Information
Symbol
hsa_chr7_0177400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTN_0028
Host gene
PTN
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
7:136975400-136976488
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:137290653-137291741
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-240.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-263.27 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
220.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((........((.(((((((.(((..(((((........((((((....))))))((((((.(((((((.....(((((......(((((..........)))))......((((((.((((((((((.(((......((((((.....))))))((((.......))))....................................(((((.((((((.....)))))).)))))...)))))).............................((((((..(((((((((((.(((((((...(((((((((((...........)))))))).)))((((((((.....))))))))...((((((....))))))(((((...(((((((....((((((...((((((........)))))).(((((((((...))))).)))))))))).)))))))....)))))......(((.(((((((((((((....)))))................)))))))).)))............((((......))))..((((((....(((.(.((.......)).).)))....))))))))))))).)))))))))))...)))))).(((((((((.(((..............(((((((.((.....((((((((......))))))))...((((((((....))))..))))((((.....))))...(((((......)))))........)).))))))).....))).)))))))))..))))))).)))))).((((...)))).)))))........)))))))..))))))....(((((((.((((((((((.....))))))...)).....(((.....))).)))))))))..)))))..))))))))))))........)))))..((.((((....(((((.((((.......)))))))))...(((((.((((((..((((((((.((..(((((.(((...)))..)))))..)).)))))).)).....)))))).)))))............)))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,...............{{...,{(,....}}}......{..((((((....}))))).|}.(((((.....)))))...}}.))((((((((({{{{({,..{(((.{(({..........}}}}.)))}.,|....{{{(((..(((((.,{{,{,((((.......))))...............................,{{{.(((((.((((((.....)))))).))))),}},..................................((((((.,(((((((((((.(((((((,..,,,((((((((...........)))))))).,,}((((((((.....)))))))),..(((({{....}})))|{((({...(((((((....,{{(({...((((((........)))))).((({(((({...})))).)))}}))))}.)))))))....))))},..,,.{((.(((((((({{{{{....}}}}}.........,,.....)))))))).}|||||||.,,,...((((......))))..,{{{{({,.,(({...{{.......}),)}))),}}}))))}}))))))).))))))))))),,.))))))....((((((........))))))....}}}}}}.......({((((((((......))))))))}.{((({{({{....})))..))))}.{(((((((((....(((((......)))))............,.......((((((..{,,{({,.,,{{{{,.....{(((.((((...)))))))),)))})})),..)))))).((((((..,.(((((((.((.{((((((.....)))))).{{{{.....,,|},...,,}.))))))))).,((((((((.,.((((..(((((((...,{{{{((((((...))))))(((.((((.......)))))))....,})}}))))))))))).,.)))).))))..)))))))))))))}.)}((((((((....)))))))).)))))...)))))}.))))))).)))..))))
Forensic Context
No forensic context available.